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最大規(guī)模蛋白組學研究為早診提供參考

作者: 來源: 發(fā)布時間:2024-09-02

英國研究者Carrasco-Zanini等報告的研究顯示,通過先進的蛋白質(zhì)組學分析技術(shù),可為及時診斷數(shù)十種疾病提供新契機。根據(jù)血液中幾種蛋白質(zhì)的“特征”,即可有效識別出數(shù)十種疾病的高危個體,而這些疾病中有一些目前可能需要數(shù)月甚至數(shù)年的時間才能確診。(Nat Med. 2024年7月22日在線版)

該研究基于迄今最大規(guī)模的蛋白質(zhì)組學研究:英國生物樣本庫制藥蛋白質(zhì)組學項目(UK Biobank Pharma Proteomics Project)。這是由多家醫(yī)藥公司和研究機構(gòu)合作的前競爭聯(lián)盟,旨在對英國生物樣本庫參與者的血漿樣本進行蛋白質(zhì)組學特征的分析,找出與健康和疾病的關(guān)聯(lián),加速生物標志物、預(yù)測模型和療法的開發(fā)。

研究者隨機選擇了4萬多名參與者提供的樣品,對大約3000種血漿蛋白進行了測量,并將獲得的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)與參與者的電子病歷記錄相結(jié)合進行關(guān)聯(lián)分析。隨后,研究者根據(jù)這些數(shù)據(jù)建立了疾病預(yù)測的稀疏模型,每種疾病以5~20種蛋白質(zhì)的特征作為參數(shù),預(yù)測了218種常見病和罕見病在10年里的發(fā)病可能。

研究者將這些用蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)開發(fā)的預(yù)測模型與采用基本臨床記錄信息開發(fā)的預(yù)測模型進行比較,發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)特征預(yù)測模型對于67種疾病的識別顯示出更強的性能。與結(jié)合了臨床檢測數(shù)據(jù)(例如血細胞技術(shù)、膽固醇水平等)和基本臨床記錄信息建立的模型相比,只需要5~20種蛋白質(zhì)特征的預(yù)測模型也在52種疾病的預(yù)測上有更好的表現(xiàn),包括多發(fā)性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、運動神經(jīng)元疾病、肺纖維化和擴張型心肌病等。

以多發(fā)性骨髓瘤為例,根據(jù)新診斷患者骨髓樣本的單細胞測序數(shù)據(jù),用于蛋白質(zhì)預(yù)測模型的5種蛋白質(zhì)中有4種在其漿細胞中有特異性表達,也就可理解為何這些蛋白質(zhì)具有強大的預(yù)測能力。

研究者指出,利用蛋白質(zhì)組學建立的這種預(yù)測方法具有疾病篩查的潛力,從而有望通過早發(fā)現(xiàn)、早干預(yù)來改善疾病的預(yù)后。不過,這種方法還需要在更廣泛的人群中進行驗證,包括有無疾病癥狀和體征的人群,并且在臨床環(huán)境中進一步評估其效果。

(編譯 張嘉佳)