5個(gè)基因的分類法有望早期診斷胰腺癌
多數(shù)胰腺癌患者診斷時(shí)已處于晚期,已無(wú)治愈的可能。Beth Israel Deaconess醫(yī)學(xué)中心(BIDMC)研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)并驗(yàn)證了一個(gè)5個(gè)基因分類法,可以有效準(zhǔn)確地從非惡性組織中識(shí)別出早期胰腺癌。(Oncotarget. 2016年2月29日在線版)
BIDMC蛋白質(zhì)組學(xué)的基因組學(xué)、生物信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)中心主任及哈弗醫(yī)學(xué)院副教授Towia Libermann表示,胰腺癌因其發(fā)病率接近死亡率,因此被認(rèn)為是一種致命性的疾病。超過(guò)90%的胰腺癌患者在診斷時(shí)已發(fā)生轉(zhuǎn)移并且治療手段十分有限,早期診斷成為一種有效的延長(zhǎng)胰腺癌患者生存的手段。雖然目前缺乏可靠的與胰腺癌相關(guān)的腫瘤標(biāo)志物、早期指標(biāo)及危險(xiǎn)因素,但這種可以區(qū)分健康組織與惡性組織的方法為胰腺癌的早期診斷、早期治療帶來(lái)了希望。
研究細(xì)節(jié)
研究人員通過(guò)一些公開(kāi)獲得的胰腺癌基因表達(dá)數(shù)據(jù)集,研發(fā)了一種再次分析所有數(shù)據(jù)集的方法,并應(yīng)用嚴(yán)格的統(tǒng)計(jì)學(xué)標(biāo)準(zhǔn)比較了不同平臺(tái)及不同實(shí)驗(yàn)室之間的數(shù)據(jù)集。研究小組進(jìn)一步選擇一個(gè)亞數(shù)據(jù)集用來(lái)開(kāi)發(fā)一個(gè)區(qū)別胰腺癌和健康胰腺組織的模板,并應(yīng)用這一“胰腺癌預(yù)測(cè)指標(biāo)”對(duì)其余的數(shù)據(jù)集進(jìn)行獨(dú)立的驗(yàn)證以證實(shí)該標(biāo)志物的準(zhǔn)確性。
在獨(dú)立驗(yàn)證5個(gè)胰腺癌基因預(yù)測(cè)模板可以區(qū)別癌癥及正常組織后,研究者們將此預(yù)測(cè)模板進(jìn)一步在包括胰腺良性病變(包括胰腺炎和早期胰腺癌)的數(shù)據(jù)集中進(jìn)行驗(yàn)證。此預(yù)測(cè)模板可以準(zhǔn)確區(qū)分出胰腺癌、良性胰腺病變、早期胰腺癌和健康胰腺組織。該預(yù)測(cè)模板在4個(gè)訓(xùn)練集中區(qū)分胰腺癌和非腫瘤樣本的平均敏感性為95%,特異性為89%,在5個(gè)獨(dú)立驗(yàn)證集顯示有相似效能(敏感性94%,特異性90%)。
BIDMC基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、生物信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)中心聯(lián)合主任及HMS醫(yī)學(xué)助理教授Manoj Bhasin表示:“我們應(yīng)用創(chuàng)新性數(shù)據(jù)和基因選擇方法,合并了多項(xiàng)基因研究的統(tǒng)計(jì)效能,且消除其變異性和批次效應(yīng),最終確定可靠的胰腺癌早期診斷生物標(biāo)志物?!?/p>
未來(lái)的應(yīng)用
BIDMC病理學(xué)助理教授Roya Khosravi-Far表示:“能精確區(qū)別晚期/早期胰腺癌與正常胰腺/良性胰腺病變的5個(gè)胰腺癌基因生物標(biāo)志物模板有助于胰腺癌的早期診斷。我們的發(fā)現(xiàn)或許為胰腺癌的早期診斷提供了機(jī)會(huì),使早期干預(yù)和更有效的治療這一致命性疾病并提高患者生存率成為可能?!?/p>
這個(gè)模板首選會(huì)應(yīng)用于胰腺癌常規(guī)的細(xì)針穿刺活檢標(biāo)本的診斷分析,以及預(yù)測(cè)良性胰腺囊腫(有時(shí)是胰腺癌的先兆)的惡性潛質(zhì)。另外,在提供了一個(gè)新的診斷工具的同時(shí),這一方法或許還為研究胰腺癌如何發(fā)生提供新的視角。
Libermann解釋道,因?yàn)檫@5個(gè)基因在胰腺癌發(fā)病中如此早期地出現(xiàn),可能是胰腺癌發(fā)生的驅(qū)動(dòng)基因,或許可以成為相當(dāng)有效的治療靶點(diǎn)。TMPRSS4、AHNAK2、POSTN、ECT2和SERPINB5這5個(gè)基因大多與胰腺癌或其他癌癥的遷移、浸潤(rùn)、粘附和轉(zhuǎn)移相關(guān)。
研究人員的下一步計(jì)劃是在臨床前瞻性研究中評(píng)價(jià)并驗(yàn)證這5個(gè)基因的診斷精確性。Libermann表示:“在未來(lái),我們將探索將這個(gè)基于組織的診斷方法轉(zhuǎn)變?yōu)闊o(wú)創(chuàng)性(血或尿)測(cè)試的可能性。”
Bhasin補(bǔ)充表示:“為進(jìn)一步增強(qiáng)這個(gè)生物標(biāo)志物的診斷效能,我們計(jì)劃利用包括胰腺癌相關(guān)的非編碼RNA、蛋白、代謝產(chǎn)物和突變等一系列標(biāo)志物來(lái)擴(kuò)展標(biāo)志物范圍。這在同類生物標(biāo)志物研發(fā)中史無(wú)前例,這類生物標(biāo)志物從多基因角度測(cè)量胰腺癌的變化,以便作出高度準(zhǔn)確的診斷?!?/p>
(編譯 白明 審校 巴一)
