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北京大學腫瘤醫(yī)院

全球腫瘤快訊

會議特別報道

新技術(shù)檢測循環(huán)腫瘤DNA或更高效

發(fā)表時間:2017-07-03

    美國紀念斯隆凱特琳癌癥中心Pedram Razavi報告,自患者血樣中發(fā)現(xiàn)的一種新的高強度基因測序法可高比例檢測出循環(huán)腫瘤DNA。在這項入組124例乳腺癌、肺癌前列腺癌患者的研究中,即便腫瘤中僅存在一個基因突變,新的高強度基因測序法的檢出率仍達89%??傮w而言,經(jīng)組織樣本證實,新測序法的基因突變檢出率為73%。(2017年ASCO年會. 摘要號LBA11516)

    方法介紹

    研究中所采用的高強度基因測序法極具優(yōu)勢,兼顧了檢測“寬度”和“深度”兩方面的需求。該方法可大范圍地檢測基因組,包括508個基因和超過200萬個堿基對;精確度也非常高,基因組的每個區(qū)域都可被測序6萬次,因此較常規(guī)測序技術(shù)可多出100倍的數(shù)據(jù)。這巨量的數(shù)據(jù)有助于開發(fā)血液檢測儀早期發(fā)現(xiàn)癌癥。目前的液態(tài)活檢技術(shù),包括商業(yè)化的檢測,均是檢測已確診的癌癥患者,其所提供的信息僅為龐大基因組信息中的一小部分,其目的是輔助監(jiān)測疾病或發(fā)現(xiàn)活性突變以利于匹配可獲得的藥物或臨床試驗;但新的高強度基因測序法與上述技術(shù)截然不同。“新的高強度基因測序法是可行的,且可為臨床決策提供無價的信息,而不需要任何的腫瘤組織樣本?!盧azavi表示,“該研究向通過血檢早期發(fā)現(xiàn)癌癥的目標邁出了重要的一步。”

    Razavi介紹,自血樣中檢測腫瘤DNA猶如大海撈針,因為每100個DNA片段中可能僅有1個片段是來自腫瘤細胞,其余的都來自正常細胞,且主要來自骨髓細胞。采用的聯(lián)合分析技術(shù)在鑒別腫瘤DNA方面更敏感,深度測序技術(shù)使他們能發(fā)現(xiàn)罕見的腫瘤DNA片段?;颊叩哪[瘤可能存在多種基因突變,既包括相同腫瘤不同部分中的不同突變,也包括腫瘤播散各位置中的不同突變。因此,基因組全范圍測序?qū)﹁b別基因突變的數(shù)量和多樣性而言都至關(guān)重要。

    研究詳情

    研究者前瞻性地收集了161例轉(zhuǎn)移性乳腺癌、NSCLC、激素抵抗性前列腺癌患者的血樣和組織樣本,但因37例的腫瘤樣本或游離DNA基因分析結(jié)果不可用而被排除研究。結(jié)果顯示,在89%的患者中,血樣中至少能檢測出腫瘤的1個基因突變;具體而言,在轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者中該檢出率為97%,在NSCLC患者中的為85%,在轉(zhuǎn)移性前列腺癌中的為84%。在三種腫瘤的組織樣本中,研究者共發(fā)現(xiàn)了864個基因突變,其中627個(73%)也可自血樣中檢出。尤其重要的是,在未知腫瘤組織分析數(shù)據(jù)的情況下,血檢76%的活性突變后來被組織檢測結(jié)果所證實。

    研究評述

    “之前相關(guān)研究的主要著重點為,使用來自腫瘤組織的鑒別信息來查找腫瘤DNA;而本研究結(jié)果使我們在沒有腫瘤組織信息的前提下高度自信地在全基因組范圍內(nèi)檢測循環(huán)腫瘤DNA中的突變?!盧azavi表示。

    ASCO專家John Heymach表示:“我們接連不斷地見到充滿希望的報告提示使用循環(huán)腫瘤DNA。在該技術(shù)被證實可用于癌癥的早期發(fā)現(xiàn)之前,這種方法不失為一條可行之路?!?/p>

    (編譯 張海峰)