原發(fā)灶不明的腫瘤，終于可以不那么“神秘叵測”了。研究發(fā)現(xiàn)，表觀遺傳學檢測，通過DNA甲基化狀態(tài)，能判斷出腫瘤的原發(fā)灶所在，準確率高達87%。(Lancet Oncol. 2016年8月26日在線版)

　　究者設計了名為EPICUP的檢測分析，基于芯片DNA甲基化標志物來區(qū)分腫瘤類型，在2790例樣本組成的試驗集中分析了38種未知腫瘤，進而在7691例樣本的驗證集中對已知腫瘤類型進行了驗證分析，又在216例未知腫瘤類型樣本集中進行了預測分析。

　　研究詳情

　　研究者最初從693例樣本中檢測DNA甲基化標志物，得到38種腫瘤的DNA甲基化譜。用基因芯片方法確定了人類基因組50萬CpG島的甲基化狀態(tài)，人類基因組計劃(TCGA)也用的同樣的方法分析大量人類腫瘤甲基化狀態(tài)。研究者納入2098例未知部位腫瘤樣本，組成共2790例的樣本集;另納入1948例PEBC隊列的獨立樣本和5743例來自TCGA的樣本，涵蓋相同的38種腫瘤。

　　分析發(fā)現(xiàn)，EPICUP檢測在驗證集中區(qū)分腫瘤類型的特異性(真陰性率)為99.6%，敏感性(真陽性率)為97.7%，陽性預測值為88.6%，陰性預測值為99.9%。用于534例未知原發(fā)灶的轉(zhuǎn)移病灶分析，EPICUP可正確地區(qū)分其中501例(94%)轉(zhuǎn)移灶的腫瘤類型。

　　研究還發(fā)現(xiàn)，EPICUP中所用樣本類型，不影響其預測腫瘤類型的效能，用新鮮冷凍標本或福爾馬林固定石蠟包埋的樣本都行。這很大程度上解決了臨床上組織樣本的實際問題。

　　研究者用EPICUP對216例未知部位腫瘤患者進行了分析驗證，188例標本被EPICUP準確預測了原發(fā)部位，準確性在96%~100%(1例尸檢、181例光學顯微鏡檢、43例免疫組化特定標志物檢測)。

　　研究者分析了EPICUP預測原發(fā)部位后治療(31例)與經(jīng)驗治療(61例)患者，接受預測部位后相應治療的患者總生存顯著較長(P=0.0029)。不過這是回顧性分析，不是前瞻性試驗設計，另外確定原發(fā)灶后的相應的合適的治療如何界定，也是問題。這一檢測能預測原發(fā)灶，這沒問題，但這種預測能否就此改善患者轉(zhuǎn)歸，還懸而未決。

　　研究者說和評論

　　研究者認為，該研究最重要的意義在于，如果能準確判斷發(fā)生轉(zhuǎn)移的原發(fā)腫瘤灶所在，從而接受相應的治療可能因此改善患者的總生存，EPICUP就能達到這樣的期冀。

　　許多基因都有腫瘤特異性的DNA甲基化狀態(tài)，異常DNA甲基化在人類腫瘤中無所不在。研究者基于DNA甲基化狀態(tài)用表觀遺傳學作為分子標志物來判斷腫瘤原發(fā)灶，結(jié)果令人振奮。

　　有評論者指出，盡管研究者在結(jié)論中很有信心地指出，盡管這一檢測可很準確地告訴我們原發(fā)腫瘤位置，到底這是否能為患者真正帶來獲益還需要前瞻性研究進行探討。

　　也有醫(yī)生用一些診斷性手段比如Pathway Diagnostics和BioTheranostics Cancer Type ID等，這些預測腫瘤來源的準確性也在75%~92%，這些檢測基于mRNA表達，不是很穩(wěn)定，EPICUP可能是最行之有效的。不過所有這些檢測手段均未獲得美國國家癌癥綜合網(wǎng)絡(NCCN)推薦。除非確證可為患者帶來明確獲益，否則不宜在臨床上常規(guī)應用。

　　(編譯 王嵐)