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北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院

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透明細(xì)胞子宮內(nèi)膜癌基因測(cè)序揭示了體細(xì)胞突變譜

發(fā)表時(shí)間:2017-06-02

    美國(guó)馬里蘭國(guó)家人類基因組研究所的Le Gallo M等報(bào)告的一項(xiàng)研究顯示,透明細(xì)胞性子宮內(nèi)膜癌(CCEC)、漿液性子宮內(nèi)膜癌(SEC)和子宮內(nèi)膜癌(EEC)有著相似的分子機(jī)制,并暗示TAF1可能是CCEC新的候選驅(qū)動(dòng)基因。(Cancer. 2017年5月9日在線版)

    CCEC作為一個(gè)預(yù)后相對(duì)不良的病理類型,其分子發(fā)病機(jī)制至今沒有確定。在一個(gè)大樣本隊(duì)列研究中,研究者對(duì)CCEC患者進(jìn)行全外顯子測(cè)序,從而發(fā)現(xiàn)新的體細(xì)胞突變基因,并評(píng)估了已知和候選驅(qū)動(dòng)基因的突變圖譜。

    研究者對(duì)16例CCEC患者(12例CCEC患者以及4例混合病理類型的CCEC患者)的腫瘤細(xì)胞和正常細(xì)胞的DNA進(jìn)行了全外顯子測(cè)序。對(duì)另外47例CCEC患者的22個(gè)基因通過(guò)Sanger法來(lái)測(cè)序。微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)和微衛(wèi)星穩(wěn)定性(MSS)由5個(gè)單核苷酸重復(fù)序列的基因分型來(lái)決定。

    2個(gè)腫瘤外顯子與高負(fù)荷突變和MSI相關(guān)。其他14個(gè)腫瘤外顯子為MSS,在222個(gè)編碼蛋白的基因中,存在236個(gè)非同義性突變或剪接連接體的體細(xì)胞突變。在63例CCEC患者體內(nèi),發(fā)現(xiàn)了以下基因突變的頻率:TP53(39.7%)、PIK3CA(23.8%)、PIK3R1(15.9%)、ARID1A(15.9%)、PPP2R1A(15.9%)、SPOP(14.3%)、TAF1(9.5%)、MSI(11.3%)。8例TAF1突變中的5例位于推測(cè)的組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域內(nèi),并包含2個(gè)反復(fù)突變的殘留。根據(jù)MSI模式和7個(gè)突變基因,CCEC分子亞型類似于SEC或EEC。

    (編譯 馬可心 審校 張為遠(yuǎn))