結(jié)直腸癌中細胞毒性T淋巴細胞(CTLs)浸潤水平較低是免疫療法的一大挑戰(zhàn)。結(jié)直腸癌的共識分子亞型(CMS)基于腫瘤屬性對患者進行了分類，其中CMS1患者占絕大多數(shù)，這類患者表現(xiàn)為高水平的CTL浸潤和以及“炎性”腫瘤。表觀遺傳修飾在基因表達和治療耐藥中起關(guān)鍵作用。在當前研究中，研究者比較了CMS1類患者與其他CMS類患者的DNA甲基化、基因表達和CTL浸潤，以確定能夠改善CRC中免疫治療的靶點。(摘要號25)

基于TCGA中RNA測序(511例)以及DNA甲基化(316例)的相關(guān)數(shù)據(jù)探索不同CMS患者基因表達以及甲基化的特征。以CMS1為參考，與其他亞型(CMS2~4)進行比較?；贛CPcounter的方法對腫瘤CTL的浸潤水平進行測定。

CMS1和CMS2相比，ARHGAP9、TBX21以及LAG3甲基化水平存在差異，并與CTL評分相關(guān)。CMS2中，ARHGAP9和TBX21表達降低，且呈現(xiàn)低甲基化。CMS1和CMS3相比，CMS3中ARHGAP9、TBX21、FMNL1、HLA-DPB1、STX11表達水平均下調(diào)，且與CTL評分高度相關(guān)。CMS3中ARHGAP9、FMNL1、HLA-DPB1和STX11的甲基化程度較低，TBX21在兩組中均存在甲基化但在CMS1中甲基化水平較高。CMS1和CMS4相比，CMS4患者中TBX21是唯一出現(xiàn)下調(diào)、低甲基化的基因，且與CTL評分高度相關(guān)。

研究者將CMS1與其他CMS組進行比較，發(fā)現(xiàn)有6個基因存在表達以及甲基化的差異，且與CTL浸潤水平呈現(xiàn)高度相關(guān)。與CMS1相比，TBX21是CMS2-4中唯一一個存在基因表達以及甲基化差異，且與CTL評分高度相關(guān)的基因。T-bet可能是CRC中T細胞反應(yīng)的關(guān)鍵調(diào)控因子。 (編譯 趙英穎)