片段分析檢測(cè)MET14外顯子14跳躍或優(yōu)于二代測(cè)序
法國(guó)研究者Loyaux等報(bào)告,片段分析對(duì)比二代測(cè)序篩查非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)腫瘤樣本,前者可發(fā)現(xiàn)后者漏檢的大塊MET14外顯子跳躍缺失突變。一線(xiàn)治療決策中必須檢測(cè)MET改變,這樣才能發(fā)現(xiàn)MET14外顯子14跳躍,以便患者接受靶向治療(如Capmatinib),并識(shí)別出免疫治療反應(yīng)可能較差的患者。(2020 MAP大會(huì). 摘要號(hào)4MO. Ann Oncol. 2020: 31: S1218.)
為了評(píng)估二代測(cè)序?qū)Ρ绕畏治鲈贛ET14外顯子跳躍突變(包括起致癌作用的MET14外顯子跳躍缺失突變,在1%~4%的NSCLC腫瘤中表達(dá)),研究者應(yīng)用這兩種技術(shù)檢查了87例NSCLC野生型患者腫瘤樣本中的MET14外顯子。
結(jié)果顯示,13例患者檢出MET14外顯子跳躍改變,其中8例的樣本具有影響剪接位點(diǎn)的缺失,5例存在剪接變體。在8份缺失樣本中,2份為41bp和66bp的大塊缺失。這兩個(gè)缺失僅能通過(guò)片段分析確定,而二代測(cè)序則未檢出。肉瘤樣樣本中無(wú)富集??梢?jiàn)與PD-L1表達(dá)的關(guān)聯(lián),攜帶MET14外顯子跳躍的樣本比本研究篩選的其他樣本具有更高的PD-L1值。
研究者認(rèn)為,這些結(jié)果突出了二代測(cè)序技術(shù)在分析大塊缺失和假陰性結(jié)果風(fēng)險(xiǎn)方面的局限性。標(biāo)準(zhǔn)管線(xiàn)和面板下的二代測(cè)序可能無(wú)法檢出MET14外顯子突變。為了避免遺漏,可以替代性地使用互補(bǔ)方法或包括大范圍內(nèi)含子的篩查,以免改變NSCLC患者一線(xiàn)治療選擇。 (編譯 李蘭清)
