美國華盛頓大學(xué)Spencer等報(bào)告，與標(biāo)準(zhǔn)的細(xì)胞遺傳學(xué)分析相比，全基因組測序(WGS)可提供更多的髓系惡性腫瘤遺傳學(xué)信息，并改變了16%的患者的風(fēng)險(xiǎn)分類。WGS法不但可識(shí)別出細(xì)胞遺傳學(xué)分析能檢出的所有易位和拷貝數(shù)變化，還在235例患者中發(fā)現(xiàn)了另外40個(gè)異常。(N Engl J Med. 2021; 384: 924-935. DOI: 10.1056/NEJMoa2024534)

腫瘤遺傳學(xué)分析已越來越成為多種癌癥診斷檢查的標(biāo)準(zhǔn)部分。WGS定義的風(fēng)險(xiǎn)分組與臨床結(jié)局相關(guān)，但WGS風(fēng)險(xiǎn)分層患者的細(xì)胞遺傳學(xué)結(jié)局尚無定論。

為了明確WGS分析在癌癥患者常規(guī)分析中的可行性，研究人員開發(fā)了一種簡化的方法，用于急性髓系白血病(AML)或骨髓增生異常綜合征(MDS)患者的WGS分析。

研究者實(shí)時(shí)分析了臨床樣本，以評估WGS在臨床環(huán)境中的可行性、準(zhǔn)確性和實(shí)用性。

結(jié)果顯示，WGS分析了235例已確診或疑似血液系統(tǒng)腫瘤患者的樣本。既往的細(xì)胞遺傳學(xué)分析已鑒別出91個(gè)拷貝數(shù)變化和40個(gè)復(fù)發(fā)性易位。WGS分析不但識(shí)別出了所有這些異常，還發(fā)現(xiàn)了另外40個(gè)新的臨床可報(bào)告的基因組事件，這意味著17%的患者具有常規(guī)細(xì)胞遺傳學(xué)無法檢出的變異。

為了檢測WGS分析在臨床腫瘤學(xué)實(shí)踐中常規(guī)使用的可行性，研究人員對117例連續(xù)入組患者進(jìn)行了前瞻性評估。WGS分析每周進(jìn)行一次，每次檢測1~11份樣本(骨髓抽吸物)。該流程所需的中位時(shí)間為5.1天。

7份樣本需要人工設(shè)置自動(dòng)化檢測程序，但另110份樣本則無需其他干預(yù)即可自動(dòng)生成最終的測序報(bào)告。WGS分析發(fā)現(xiàn)117例患者中有29例(24.8%)存在新的遺傳信息，這導(dǎo)致19例(16.2%)的風(fēng)險(xiǎn)分類發(fā)生了變化。

研究者表示，WGS分析提供了一種無偏檢測所有類型突變的方法，并且有可能取代當(dāng)前的檢測方法。WGS分析在細(xì)胞遺傳學(xué)分析方面具有成本競爭力，并且可被廣泛應(yīng)用于惡性腫瘤。隨著測序成本的降低，WGS分析可能會(huì)與常規(guī)檢測平臺(tái)等價(jià)。

(編譯 王子涵)