美國(guó)加州大學(xué)舊金山分校Gu等報(bào)告，腦脊液(CSF)宏基因組二代測(cè)序(mNGS)檢測(cè)對(duì)樣本量的要求低，不需要保持細(xì)胞的完整性，雖然最初開(kāi)發(fā)用被于診斷神經(jīng)系統(tǒng)感染，但在細(xì)胞學(xué)檢測(cè)和(或)流式細(xì)胞術(shù)陰性且假陽(yáng)性風(fēng)險(xiǎn)很低的中樞神經(jīng)系統(tǒng)(CNS)惡性腫瘤患者中也可以檢測(cè)CSF中的遺傳證據(jù)。(JAMA Neurol. 2021 年 9 月 13 日在線版 DOI:10.1001/jamaneurol.2021.3088)

CSF細(xì)胞學(xué)檢測(cè)和流式細(xì)胞術(shù)診斷CNS腫瘤不敏感。為了確定CSF mNGS在難以確診的CNS惡性腫瘤病例中是否可以識(shí)別出非整倍體(惡性腫瘤的標(biāo)志)，研究者在加州大學(xué)舊金山分校(UCSF)進(jìn)行了兩項(xiàng)病例對(duì)照研究。

第一項(xiàng)研究使用了2017年7月1日至2019年12月31日在UCSF臨床實(shí)驗(yàn)室收集的CSF標(biāo)本，并評(píng)估了CNS惡性腫瘤患者(陽(yáng)性對(duì)照)或無(wú)CNS惡性腫瘤(陰性對(duì)照)患者標(biāo)本的檢測(cè)性能，將結(jié)果與CSF細(xì)胞學(xué)檢測(cè)和/或流式細(xì)胞術(shù)的結(jié)果進(jìn)行比較。

第二項(xiàng)研究評(píng)估了2014年4月1日至2019年7月31日一項(xiàng)正在進(jìn)行的前瞻性研究中的患者，這些患者呈神經(jīng)炎癥性疾病的表現(xiàn)，但最終被診斷為CNS惡性腫瘤。主要終點(diǎn)為CSF mNGS檢測(cè)非整倍體的敏感性和特異性。次要子集分析包括CSF和腫瘤組織染色體異常的比較，以及與檢測(cè)性能相關(guān)的神經(jīng)影像學(xué)特征的識(shí)別。

結(jié)果顯示，兩項(xiàng)研究共包括130例患者，中位年齡57.5歲(IQR：43.3~68.0歲)，72例(55.4%)為男性。檢測(cè)性能研究使用了來(lái)自47例CNS惡性腫瘤患者和56例其他的神經(jīng)系統(tǒng)疾病患者的125份實(shí)驗(yàn)室CSF殘留樣本。神經(jīng)炎癥疾病研究招募了12例患者和17例匹配的對(duì)照參與者。

CSF mNGS檢測(cè)的敏感性為75%(95%CI 63%~85%)，特異性為100%(95%CI 96%~100%)。使用非診斷性細(xì)胞學(xué)和(或)流式細(xì)胞術(shù)的檢測(cè)性能研究在64%(95%CI 41%~83%)的患者中檢測(cè)到非整倍體，在神經(jīng)炎癥疾病研究?jī)?nèi)最終被確診為CNS惡性腫瘤的患者中為55%(95%CI 23%~83%)。在非整倍體患者中，38例(90.5%)呈多拷貝數(shù)變異，腫瘤比例為31%~49%。

(編譯 張書(shū)語(yǔ))