復旦大學附屬中山醫(yī)院Li等報告，8-CpG DNA甲基化特征是Ⅱ期結直腸癌患者疾病復發(fā)的可靠預后和預測工具。(Br J Cancer. 2023年2月24日在線版)

Ⅱ期結直腸癌的主要挑戰(zhàn)是識別復發(fā)風險增加的患者。目前缺乏區(qū)分預后差患者和無復發(fā)患者的生物標志物。該研究旨在開發(fā)一種強大的DNA甲基化分類器，用于預測Ⅱ期結直腸癌患者的復發(fā)和化療獲益。研究者對243例Ⅱ期結直腸癌樣本進行了全基因組DNA甲基化捕獲測序，并確定了由8個CpG位點組成的復發(fā)特異性DNA甲基化標志。

該研究入組243例Ⅱ期結直腸癌患者。為了在復發(fā)和非復發(fā)的Ⅱ期結直腸癌樣本中選擇不同的甲基化位點，使用Agilent SureSelectXT Human Methyl-Seq(用于分析CpG甲基化的一個綜合靶點富集系統)分析了62個腫瘤樣本(包括31個復發(fā)和31個非復發(fā)樣本)的DNA甲基化譜。應用焦磷酸測序技術定量243例患者候選DNA甲基化位點的甲基化水平。

通過DNA甲基化捕獲測序，該研究在Ⅱ期CRC中發(fā)現了一個與復發(fā)相關的DNA甲基化特征，包括8個CpG位點。分類器顯示出明顯高于任何臨床病理風險因素的預后準確性。Kaplan-Meier生存曲線顯示高危評分與不良預后相關。在多因素分析中，該特征是最顯著的預后因素，HR為2.80(95%CI 1.71~4.58，P<0.001)。該特征可以識別適合輔助化療的患者。 (編譯 王城)