根據(jù)一項(xiàng)新的研究結(jié)果顯示，腫瘤周圍的微生物可用以篩查結(jié)腸癌，它比糞便潛血試驗(yàn)具有更高的敏感性和特異性。(2015年美國(guó)人類遺傳學(xué)學(xué)會(huì))

明尼蘇達(dá)大學(xué)的Blekhman表示，這項(xiàng)研究在結(jié)腸癌中很重要，因?yàn)槊總€(gè)腫瘤可能有不同的基因突變而表現(xiàn)出不同的表型，這可能對(duì)微生物造成影響。Blekhman等比較了健康的結(jié)腸細(xì)胞和來(lái)自結(jié)直腸癌患者的腫瘤細(xì)胞之間的遺傳差異，發(fā)現(xiàn)腫瘤特異性突變與腸道中的特定細(xì)菌的存在相關(guān)。例如，存在APC基因突變的患者，與一種遺傳性腫瘤綜合征家族性腺瘤樣息肉病密切相關(guān)，同時(shí)腫瘤周圍存在豐富的梭桿菌屬。Blekhman的實(shí)驗(yàn)室是第一個(gè)研究特定腫瘤的基因突變與腫瘤微生物群間關(guān)系的實(shí)驗(yàn)室。

更多的突變，更多的多樣性

研究人員通過(guò)全基因組測(cè)序來(lái)評(píng)估44例結(jié)腸癌患者的腫瘤蛋白編碼區(qū)和微生物菌群分布的特點(diǎn)，這些微生物菌群存在于腫瘤活檢標(biāo)本和正常結(jié)腸組織標(biāo)本中。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，若出現(xiàn)更多基因突變，腫瘤周圍則存在更多不同的細(xì)菌種群。而對(duì)于某些基因，體細(xì)胞突變與特定微生物數(shù)量的變化有關(guān)，在信號(hào)通路水平也發(fā)現(xiàn)細(xì)菌與腫瘤相關(guān)的證據(jù)。腫瘤的葡萄糖運(yùn)輸途徑的功能缺失突變與微生物能量利用水平的提高密切相關(guān)，這表明，腫瘤和其附近的細(xì)菌存在資源利用的競(jìng)爭(zhēng)。

研究者創(chuàng)建了一項(xiàng)風(fēng)險(xiǎn)指數(shù)，用以評(píng)價(jià)微生物與幾個(gè)已知腫瘤驅(qū)動(dòng)突變的相關(guān)性。該指數(shù)能夠準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)參與編碼DNA修復(fù)鋅指核糖核酸酶基因ZFN717的功能缺失突變。

這些研究結(jié)果表明，可單純通過(guò)糞便樣本對(duì)腫瘤進(jìn)行基因分型，這也意味著改變腫瘤微環(huán)境可用于預(yù)防或治療結(jié)腸癌。

埃默里大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Chris Gunter評(píng)論表示，該研究揭示了“隱藏的遺傳問(wèn)題”。若通過(guò)癌癥的測(cè)序研究，可能發(fā)現(xiàn)10種突變，但還無(wú)法預(yù)測(cè)哪些是驅(qū)動(dòng)突變哪些是被動(dòng)突變。而該研究工作可以幫助醫(yī)生縮小研究的范圍，進(jìn)而增加人們對(duì)腫瘤發(fā)生機(jī)制的了解。

(編譯 楊立峰 審校 章真)