腫瘤組織中普遍存在胚系變異
美國紀念斯隆凱特琳癌癥中心的Mark Robson等報告,腫瘤組織-正常組織對比測序法顯示腫瘤患者個體中普遍存在胚系變異,可能有助于揭示胚系變異與未知綜合征間的關(guān)系。(JAMA Oncol. 2015年11月10日在線版)
腫瘤基因測序法可發(fā)現(xiàn)可能的靶基因,并可改變治療方法。目前的研究集中在發(fā)現(xiàn)腫瘤特異的基因變異上,但是針對組織胚系變異的研究同樣有助于治療手段的探究。為了通過常規(guī)臨床腫瘤測序法評估腫瘤組織胚系突變的負荷量,該研究在紀念梅隆凱特琳癌癥中心入組符合條件進展期癌癥患者,給予MSK-IMPACT檢測。MSK-IMPACT可檢測341個腫瘤組織和正常組織的基因。根據(jù)2014年3月至10月1566例經(jīng)歷腫瘤概況調(diào)查患者的結(jié)果,187個與孟德爾病相關(guān)的重疊基因為胚系基因變異。
研究終點指標包括:187個基因中,有病理意義的胚系基因變異(PPGV)的數(shù)量,意義未確定變異的數(shù)量;PPGV患者個體在臨床相關(guān)基因亞組中所占的比例,在已知腫瘤類型基因變異中所占的比例,在明確的二次突變中所占的比例。
結(jié)果顯示,1566例患者的平均年齡為58歲,54%為女性。在1566例患者中有246例患者(15.7%,95%CI14.0%~17.6%)攜帶與孟德爾病相關(guān)的胚系變異,其中198例患者攜帶與腫瘤易感性相關(guān)的基因突變。198例患者中只有81例患者(40.9%,95%CI 34.3%~47.9%)的癌癥易感性胚系變異與自身的腫瘤類型相符。
在182例腫瘤組織中具有PPGV的患者中,有39例(21.4%,95%CI 16.1%~28.0%)患者的體細胞存在其他等位基因位點的改變,其中13例患者的此類改變與胚系突變或已知的綜合征無關(guān)。55例患者(3.5%,95%CI 27.1%~45.4%)存在與癌癥無關(guān)的孟德爾基因突變。幾乎每例患者(1565例;99.9%,95%CI 99.6%~99.9%)均存在一個以上臨床意義不明的基因變異。
(編譯 李達)
