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北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院

全球腫瘤快訊

追蹤?新進(jìn)展?消化道腫瘤

食管腺癌和巴雷特食管中發(fā)現(xiàn)了新的基因位點

發(fā)表時間:2016-10-09

      英國劍橋大學(xué)Gharahkhani P等報告的一項薈萃分析發(fā)現(xiàn),巴雷特(Barrett)食管和食管腺癌的風(fēng)險突變位點的數(shù)量是之前已知位點的兩倍,并發(fā)現(xiàn)一些新的致病因。此外,食管腺癌與HTR3C、ABCC5位點間的特殊關(guān)系可能成為巴雷特食管轉(zhuǎn)變?yōu)槭彻芟侔┬碌念A(yù)測標(biāo)志物。在巴雷特食管和食管腺癌的發(fā)展中,新風(fēng)險位點的精細(xì)定位和功能檢測引領(lǐng)關(guān)鍵分子技術(shù)的進(jìn)一步提升,這也將帶動預(yù)防和干預(yù)策略的發(fā)展。(Lancet Oncol. 2016年8月12日在線版)

      在高收入水平的國家,食管腺癌的發(fā)病率逐年增長,已成為增長最快的腫瘤之一。巴雷特食管是食管腺癌的癌變前兆。然而,只有少數(shù)巴雷特食管患者發(fā)展成食管腺癌。這項國際聯(lián)合研究旨在探尋食管腺癌與巴雷特食管進(jìn)展的新的遺傳風(fēng)險變化。

      研究者自PubMed數(shù)據(jù)庫入組2016年2月29日前所有關(guān)于食管腺癌與巴雷特食管的全基因組相關(guān)研究,開展了該項大型薈萃分析,主要對組織病理學(xué)上已確診的、攜帶大量SNP的患者進(jìn)行探索分析。這些患者數(shù)據(jù)主要來自歐洲,北美,澳大利亞三地進(jìn)行的4個獨(dú)立的臨床研究。研究采用了固定效應(yīng)逆方差加權(quán)法進(jìn)行分析,調(diào)整全基因組重要位點后通過富集分析法進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析。此外,此研究通過生物信息分析法得出生理病理相關(guān)的細(xì)胞反應(yīng)機(jī)制。

      入組樣本包括巴雷特食管6167例,食管腺癌4112例,另包括4個全基因組臨床研究的代表性樣本17?159例。研究發(fā)現(xiàn)如下8個與巴雷特食管和食管腺癌相關(guān)的高風(fēng)險基因位點。

      CFTR(rs17451754;P=4.8×10-10),MSRA(rs17749155;P=5.2×10-10),LINC00208、BLK(rs10108511;P=2.1×10-9),KHDRBS2(rs62423175;P=3.0×10-9),TPPP、CEP72(rs9918259;P=3.2×10-9),TMOD1(rs7852462;P=1.5×10-8),SATB2(rs139606545;P=2.0×10-8),HTR3C、ABCC5(rs9823696;P=1.6×10-8/P=0.45)。

      其中HTR3C、ABCC5(rs9823696)位點與食管腺癌(P=1.6×10-8)密切相關(guān),與巴雷特食管(P=0.45)獨(dú)立相關(guān)。在富集分析中,研究者重新分配權(quán)重后發(fā)現(xiàn)了第9個新的風(fēng)險位點LPA(rs12207195;P=0.925)。最強(qiáng)的疾病通路(P<10-6)是肌細(xì)胞分化和間質(zhì)細(xì)胞分化。

      (編譯 謝幸娟 審校 依荷芭麗·遲)