新加坡Duke-NUS醫(yī)學(xué)院的Jusakul等的報(bào)告揭示了遺傳學(xué)、表觀遺傳學(xué)和環(huán)境致癌物質(zhì)跨越不同基因位置而相互作用的機(jī)制，這種機(jī)制導(dǎo)致了不同分子亞型的膽管癌(CCA)。(Cancer Discov. 2017年7月30日在線版)

CCA是肝膽管細(xì)胞的惡性腫瘤，在肝吸蟲(chóng)感染流行國(guó)家有較高發(fā)病率。研究分析了來(lái)自10個(gè)國(guó)家的489例膽管癌，結(jié)合了全基因組(71例)、靶標(biāo)/外顯子、基因拷貝數(shù)、基因表達(dá)和DNA甲基化信息。

數(shù)據(jù)整合分析后確定了四種CCA亞型：肝吸蟲(chóng)陽(yáng)性CCA(1/2亞型)中富含ERBB2擴(kuò)增及TP53突變;而肝吸蟲(chóng)陰性CCA(3/4亞型)具有基因改變的拷貝數(shù)高，PD-1/PD-L2表達(dá)增加，或存在表觀遺傳學(xué)突變(IDH 1/2，BAP1)和FGFR/PRKA相關(guān)的基因重排。全基因組分析強(qiáng)調(diào)，F(xiàn)GFR2 3'UTR缺失是FGFR2上調(diào)的機(jī)制之一。

綜合了蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合區(qū)域的非編碼啟動(dòng)子突變的數(shù)據(jù)分析顯示，CCA中普遍存在H3K27me3相關(guān)的調(diào)節(jié)位點(diǎn)。亞型1和亞型4具有明顯不同的CpG島DNA高度甲基化，或CpG島周邊高度甲基化。突變特征和亞克隆分析提示，這些亞型具有異于其他亞型的突變途徑。

(編譯 朱思嫻 審校 邱紅 袁響林)