高級別漿液性卵巢癌的預(yù)后基因表達譜分析
美國南加州大學(xué)Millstein等發(fā)現(xiàn),一種基因表達譜可預(yù)測高級別漿液性卵巢癌患者的2年和5年總生存,這種由101種基因組成的表達譜預(yù)測效能優(yōu)于年齡和分期,五分位患者的中位總生存分別為9.5、5.4、3.8、3.2和2.3年。與總生存相關(guān)性最強的5種基因分別為TAP1、ZFHX4、CXCL9、FBN1和PTGER3。(Ann Oncol. 2020年5月27日在線版 doi: 10.1016/j.annonc.2020.05.019)
高級別漿液性卵巢癌(HGSOC)女性的中位總生存期(OS)約為4年,但患者之間的生存差異較大。尚無與預(yù)后相關(guān)的公認(rèn)的基因表達特征。該研究的目的是為HGSOC患者的總生存期建立可靠的預(yù)后標(biāo)志。
從來自多項研究的3769例HGSOC女性患者的福爾馬林固定、石蠟包埋(FFPE)腫瘤組織中,使用NanoString技術(shù)測量了從1455種腫瘤的薈萃分析中選擇的513個基因表達。用彈性網(wǎng)型正則化進行生存分析,以開發(fā)5年OS的預(yù)后模型,15項研究中的2702個腫瘤樣本被納入訓(xùn)練集,6項研究中的1067個腫瘤樣本被納入獨立評估。
在校正協(xié)變量的單基因分析中,276個基因的表達水平與OS相關(guān)[錯誤發(fā)現(xiàn)率(FDR)<0.05]。前五位的基因是TAP1,ZFHX4,CXCL9,F(xiàn)BN1和PTGER3(P<0.001)。表現(xiàn)最好的預(yù)后標(biāo)志包括101個基因,這些基因富集于有治療意義的途徑中?;虮磉_評分(GES)每增加一個標(biāo)準(zhǔn)差,死亡風(fēng)險就會增加兩倍以上(HR=2.35,P<0.001)。根據(jù)GES五分位數(shù)分層的中位生存期分別為9.5年、5.4年、3.8年、3.2年和2.3年。
(編譯 張麗娜)
