最大規(guī)模蛋白組學(xué)研究為早診提供參考
英國(guó)研究者Carrasco-Zanini等報(bào)告的研究顯示,通過(guò)先進(jìn)的蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù),可為及時(shí)診斷數(shù)十種疾病提供新契機(jī)。根據(jù)血液中幾種蛋白質(zhì)的“特征”,即可有效識(shí)別出數(shù)十種疾病的高危個(gè)體,而這些疾病中有一些目前可能需要數(shù)月甚至數(shù)年的時(shí)間才能確診。(Nat Med. 2024年7月22日在線版)
該研究基于迄今最大規(guī)模的蛋白質(zhì)組學(xué)研究:英國(guó)生物樣本庫(kù)制藥蛋白質(zhì)組學(xué)項(xiàng)目(UK Biobank Pharma Proteomics Project)。這是由多家醫(yī)藥公司和研究機(jī)構(gòu)合作的前競(jìng)爭(zhēng)聯(lián)盟,旨在對(duì)英國(guó)生物樣本庫(kù)參與者的血漿樣本進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)特征的分析,找出與健康和疾病的關(guān)聯(lián),加速生物標(biāo)志物、預(yù)測(cè)模型和療法的開(kāi)發(fā)。
研究者隨機(jī)選擇了4萬(wàn)多名參與者提供的樣品,對(duì)大約3000種血漿蛋白進(jìn)行了測(cè)量,并將獲得的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)與參與者的電子病歷記錄相結(jié)合進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。隨后,研究者根據(jù)這些數(shù)據(jù)建立了疾病預(yù)測(cè)的稀疏模型,每種疾病以5~20種蛋白質(zhì)的特征作為參數(shù),預(yù)測(cè)了218種常見(jiàn)病和罕見(jiàn)病在10年里的發(fā)病可能。
研究者將這些用蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)開(kāi)發(fā)的預(yù)測(cè)模型與采用基本臨床記錄信息開(kāi)發(fā)的預(yù)測(cè)模型進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)特征預(yù)測(cè)模型對(duì)于67種疾病的識(shí)別顯示出更強(qiáng)的性能。與結(jié)合了臨床檢測(cè)數(shù)據(jù)(例如血細(xì)胞技術(shù)、膽固醇水平等)和基本臨床記錄信息建立的模型相比,只需要5~20種蛋白質(zhì)特征的預(yù)測(cè)模型也在52種疾病的預(yù)測(cè)上有更好的表現(xiàn),包括多發(fā)性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元疾病、肺纖維化和擴(kuò)張型心肌病等。
以多發(fā)性骨髓瘤為例,根據(jù)新診斷患者骨髓樣本的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù),用于蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)模型的5種蛋白質(zhì)中有4種在其漿細(xì)胞中有特異性表達(dá),也就可理解為何這些蛋白質(zhì)具有強(qiáng)大的預(yù)測(cè)能力。
研究者指出,利用蛋白質(zhì)組學(xué)建立的這種預(yù)測(cè)方法具有疾病篩查的潛力,從而有望通過(guò)早發(fā)現(xiàn)、早干預(yù)來(lái)改善疾病的預(yù)后。不過(guò),這種方法還需要在更廣泛的人群中進(jìn)行驗(yàn)證,包括有無(wú)疾病癥狀和體征的人群,并且在臨床環(huán)境中進(jìn)一步評(píng)估其效果。
(編譯 張嘉佳)
