黑色素瘤輔助診斷新方法的臨床應(yīng)用:準(zhǔn)備好了嗎?
在大約15%的病例中,惡性黑色素瘤與良性皮膚痣的鑒別比較困難,組織病理學(xué)的分析結(jié)果模棱兩可,所以不能較直觀地鑒別出這兩種疾病。(J Cutan Pathol.2015年3月2日在線版)
一項(xiàng)新的23基因標(biāo)志檢測(cè)(myPath Melanoma,由Myriad Genetics公司開(kāi)發(fā))在這些情況下可有助于鑒別診斷。
該檢測(cè)通過(guò)測(cè)試集開(kāi)發(fā),然后在一個(gè)獨(dú)立的隊(duì)列中驗(yàn)證。研究人員Clarke醫(yī)生是Myriad的皮膚科主任,他在一次新聞發(fā)布會(huì)中說(shuō):“myPath Melanoma是一種新的功能強(qiáng)大的分子診斷性檢測(cè)方法,它能夠分析皮膚細(xì)胞內(nèi)的遺傳信息,幫助我們了解患者皮膚病變的生物學(xué)特征,且能夠客觀地區(qū)分潛在致命性黑色素瘤和良性痣;對(duì)病理學(xué)家來(lái)說(shuō),它可以作為顯微鏡的輔助工具”。
不過(guò),紀(jì)念斯隆凱特琳癌癥中心的病理學(xué)系皮膚病理學(xué)主任Busam醫(yī)生認(rèn)為,基于目前研究報(bào)導(dǎo)的結(jié)果來(lái)看,將這項(xiàng)檢測(cè)作為診斷和臨床管理的依據(jù)還為時(shí)過(guò)早;雖然該項(xiàng)檢測(cè)與目前診斷金標(biāo)準(zhǔn)—組織病理學(xué)檢查,結(jié)果高度相關(guān)。
開(kāi)發(fā)該項(xiàng)檢測(cè)
為開(kāi)發(fā)基因標(biāo)簽用來(lái)檢測(cè),Clarke醫(yī)生的研究小組鑒定了79個(gè)候選生物標(biāo)志物基因,這些基因是從文獻(xiàn)中梳理出來(lái)的,具有所期望的能夠區(qū)分惡性黑色素瘤和良性痣的表達(dá)模式。
黑素細(xì)胞病變組織樣本經(jīng)福爾馬林固定、石蠟包埋,用以檢測(cè)基因的表達(dá)水平。在83份黑色素細(xì)胞病變的數(shù)據(jù)集中,自79個(gè)候選基因中進(jìn)一步篩選出被認(rèn)為是最有希望作為生物標(biāo)志物的40個(gè)基因。
在595份黑素瘤和痣的樣本測(cè)試集中,51份樣本因?yàn)橹匦虑谐?、缺乏足夠的組織,或因?yàn)闊o(wú)法進(jìn)行良性和惡性分類而被排除在外;42份樣本因?yàn)榇_有管家基因的表達(dá)而被排除;38份樣本因?yàn)橛胁荒鼙粰z測(cè)到的一個(gè)或多個(gè)基因的表達(dá)而被排除。其余的464份樣本可用作基因標(biāo)簽的原始開(kāi)發(fā)。
在40個(gè)候選基因中,有27個(gè)能鑒別全部的464份樣本痣和黑色素瘤。然后,研究人員使用統(tǒng)計(jì)方法完善和確定了23個(gè)基因標(biāo)簽。
為了驗(yàn)證該23基因標(biāo)簽,研究者使用從之前測(cè)試集中獲得的“預(yù)定分?jǐn)?shù)計(jì)算”,對(duì)從另外四個(gè)不同機(jī)構(gòu)獲得的571份樣本集進(jìn)行檢測(cè)。
在這571份樣本中,有20份樣本因?yàn)槭嵌吻谐臉?biāo)本被排除,有24份樣本因沒(méi)有足夠的組織進(jìn)行處理而被排除,90份樣本因基因表達(dá)水平低于可檢測(cè)水平,不能產(chǎn)生分值而被排除。在剩下的樣本中,有211份來(lái)自黑色素瘤亞型,67份來(lái)自發(fā)育不良痣,有149份來(lái)自常見(jiàn)痣。
這些驗(yàn)證樣品通過(guò)23基因標(biāo)簽進(jìn)行測(cè)試,得分從-16.7到11.1不等,低于0分提示為良性病變,高于0分提示為惡性病變。該項(xiàng)檢測(cè)正確鑒定黑素瘤和良性皮膚痣的靈敏性和特異性均為90%。
該檢測(cè)實(shí)現(xiàn)了未滿足的需求嗎?
Busam醫(yī)生介紹:據(jù)目前所有的已知情況,典型的痣和黑色素瘤病例的檢測(cè)診斷準(zhǔn)確率均高達(dá)90%”。對(duì)于分類共識(shí)所明確的良性或惡性病例,不需要額外的檢測(cè)。在大多數(shù)情況下,常規(guī)組織病理學(xué)檢查的準(zhǔn)確性更好、速度更快,而且比基因表達(dá)分析更便宜。然而,當(dāng)病理學(xué)家在常規(guī)組織病理閱片后不能確定病灶是良性還是惡性時(shí),該項(xiàng)檢測(cè)作為輔助工具對(duì)這些不確定的病灶可能有臨床價(jià)值。
在驗(yàn)證樣本中,17份樣本的組織病理診斷是模棱兩可的。9份被判定為惡性樣本(也正如23基因標(biāo)簽檢測(cè)所判定的那樣)。被判定為良性的8份樣本中,23基因標(biāo)志將4份歸類為良性,將另4份歸類為惡性。
Busam醫(yī)生坦言,然而,該檢測(cè)尚未在疑難病例中得到驗(yàn)證。為評(píng)價(jià)檢測(cè)的臨床價(jià)值,需要進(jìn)一步將基于結(jié)果的研究同常規(guī)組織病理閱片和其他輔助檢查比較,例如細(xì)胞遺傳學(xué)分析。研究人員同意需要更多的基于結(jié)果的研究和前瞻性的研究,以進(jìn)一步評(píng)估該項(xiàng)檢測(cè)的價(jià)值。
Clarke醫(yī)生補(bǔ)充表示,目前該檢測(cè)在美國(guó)正通過(guò)推出早期訪問(wèn)項(xiàng)目向病理學(xué)家免費(fèi)提供,以診斷他們的疑難病例。Myriad繼續(xù)收集真實(shí)世界病例的數(shù)據(jù),該項(xiàng)檢測(cè)要求提交5個(gè)顯微切片,進(jìn)行檢測(cè)處理需要5個(gè)工作日。 (編譯 錢(qián)磊 審校 吳荻)
