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北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院

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在漢族人群中發(fā)現(xiàn)了非賁門胃癌新的易感基因位點(diǎn)

發(fā)表時(shí)間:2016-02-04

    南京醫(yī)學(xué)科大學(xué)沈洪兵教授等通過合并兩組漢族人群的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)了非賁門胃癌新的易感基因位點(diǎn)。這一發(fā)現(xiàn)為非賁門胃癌遺傳易感性又添一新證據(jù),也為研究漢族人群非賁門胃癌的病因?qū)W提供了新線索。(Gut. 2015年12月23日在線版)

    該研究對已發(fā)表的兩項(xiàng)漢族人群的GWAS結(jié)果做了薈萃分析,其中包括2031例非賁門胃癌患者和4970例正常對照人群。隨后,對額外的3564例患者和4637例正常對照人群進(jìn)行了基因分型。

    薈萃分析顯示了兩個(gè)新的關(guān)聯(lián)信號。第一是被rs7712641所標(biāo)記位于5q14.3的新基因位點(diǎn)(等位基因OR=0.84,95%CI 0.80~0.88;P=1.21×10-11)。在長鏈非編碼RNA-POLR3G-4(XLOC_004464)的單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)志譜中,研究者發(fā)現(xiàn)該基因位點(diǎn)在非賁門胃癌組織中表達(dá)比在正常組織中的低(P=7.20×10-4)。與此同時(shí),研究者在1q22基因位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)了另一個(gè)新的信號rs80142782(等位基因OR=0.62,95%CI 0.56~0.69;P=1.71×10-19),它獨(dú)立于此前報(bào)道的在同一基因位點(diǎn)的SNP,即rs4072037(等位基因OR=0.74,95% CI 0.69~0.79;P=6.28×10-17)。對新發(fā)現(xiàn)的SNP的分析表明,其依然具有全基因組的重要性(P=3.47×10-8)。有趣的是,rs80142782在亞洲人群中很少有等位基因,頻率為0.05,而且在歐洲和非洲人群中它是單一的形態(tài)。

    (編譯 公宇 審校 項(xiàng)曉軍 熊建萍)