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北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院

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基因差異導(dǎo)致黑人患者預(yù)后劣于白人患者

發(fā)表時(shí)間:2016-05-05

    美國北卡羅萊納大學(xué)教堂山分校Lineberger癌癥中心Bhavani Krishnan等報(bào)告,美國黑人比白人的VHL基因失活相對(duì)較少,并有更加豐富的ccB分子亞型,同時(shí)可下調(diào)低氧誘導(dǎo)因子(HIF)基因。盡管在如今的靶向治療時(shí)代,生理因素致使罹患腎透明細(xì)胞癌的美國黑人的生存更加糟糕,但這些基因組差異暗示血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子靶向治療的針對(duì)性下降。(JAMA Oncol. 2016年3月24日在線版)

    既往研究發(fā)現(xiàn)患有腎透明細(xì)胞癌的美國黑人的預(yù)后具有證據(jù)確鑿的種族差異性。盡管白人患者的總體生存因?yàn)榘邢蛑委煹某霈F(xiàn)而發(fā)生了戲劇性的改善,但是美國晚期腎透明細(xì)胞癌黑人患者的總生存并未見明顯改善。對(duì)于腎透明細(xì)胞癌的腫瘤生物學(xué)行為及潛在的種族差異鮮有報(bào)道。

    為了明確患有腎透明細(xì)胞癌的白人和美國黑人體細(xì)胞突變和基因表達(dá)是否存在種族差異。本研究自癌癥基因組圖譜識(shí)別(TCGA)透明細(xì)胞腎癌(KIRC)數(shù)據(jù)集中共納入438例腎透明細(xì)胞癌患者,其中419例白人患者和19例美國黑人患者。應(yīng)用GSE25540數(shù)據(jù)集(包含135個(gè)患者;其中125例白人患者,10例美國黑人患者)來進(jìn)行驗(yàn)證。腫瘤樣本的收集來自眾多癌癥中心,同時(shí)進(jìn)行種族差異的體細(xì)胞變異率和RNA表達(dá)分析。

    主要研究終點(diǎn)為在罹患腎透明細(xì)胞癌的白人和黑人患者中比較體細(xì)胞變異率和RNA表達(dá)差異。

    結(jié)果顯示:總的來說,419例非西班牙裔白人患者和19例TCGA KIRC黑人患者被納入研究,驗(yàn)證組在公開GSE25540數(shù)據(jù)集的135例腎透明細(xì)胞癌患者中被驗(yàn)證,美國黑人患者比白人患者更可能存在VHL基因突變(17% vs 50%,P=0.04),并且有更加豐富的ccB分子亞型(79% vs 45%,P=0.005),該種分子亞型提示預(yù)后差。RNA表達(dá)分析顯示:與白人相比,美國黑人的低氧誘導(dǎo)因子(HIF)及血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(VEGF)相關(guān)通路都相對(duì)下調(diào)。

    (編譯 劉軍靈 郭放 審校 謝曉冬)