CpG甲基化預(yù)測早期肝細(xì)胞癌的復(fù)發(fā)
中山大學(xué)腫瘤醫(yī)院的Jiliang Qiu等報(bào)告的一項(xiàng)多中心研究結(jié)果顯示,MSEH,一個(gè)以3個(gè)CpG島為基礎(chǔ)的甲基化,有助于預(yù)測早期肝細(xì)胞肝癌的復(fù)發(fā)。(J Clin Oncol. 2017年1月9日在線版)
雖然越來越多的早期肝細(xì)胞癌被確診,但半數(shù)的確診患者將會(huì)復(fù)發(fā)。因此,識別復(fù)發(fā)相關(guān)標(biāo)志物已迫在眉睫。該研究調(diào)查了CpG甲基化預(yù)測早期肝細(xì)胞肝癌患者復(fù)發(fā)的有效性。
來自4個(gè)獨(dú)立中心的共計(jì)576例早期肝細(xì)胞肝癌患者按三個(gè)階段進(jìn)行分類。在探索期,對66個(gè)腫瘤標(biāo)本應(yīng)用Illumina甲基化450k芯片進(jìn)行分析。應(yīng)用LASSO和回歸特征消除法這兩種算法來選取有顯著意義的CpG島。在訓(xùn)練集,應(yīng)用Cox回歸模型進(jìn)一步縮小CpG島到140個(gè)樣本。在驗(yàn)證集,備選的CpG島應(yīng)用1個(gè)內(nèi)部隊(duì)列(141例)和2個(gè)外部隊(duì)列(191例和104例)進(jìn)行驗(yàn)證。
運(yùn)用LASSO分析和回歸特征消除法結(jié)合篩選出了46個(gè)CpG島,其中3個(gè)CpG島對應(yīng)于SCAND3、Src同源3域的生長因子受體結(jié)合因子相互作用蛋白和肽酶抑制劑3,成為訓(xùn)練集的候選預(yù)測因子。在訓(xùn)練集中,基于這3個(gè)CpG島上,發(fā)現(xiàn)MSEH(早期肝癌的甲基化特質(zhì))可以將患者區(qū)分為高/低風(fēng)險(xiǎn)復(fù)發(fā)組(P<0.001),同時(shí)在一個(gè)內(nèi)部(P<0.001)和兩個(gè)外部(P<0.001;P=0.002)驗(yàn)證集中得到驗(yàn)證。此外,一個(gè)由MSEH、腫瘤分化程度、乙型肝炎肝硬化、乙肝病毒表面抗原和抗病毒治療構(gòu)成的列線圖訓(xùn)練集可以預(yù)測5年無疾病復(fù)發(fā)生存率,并且在其他三個(gè)驗(yàn)證集中也有良好的一致性(一致性指數(shù)分別為:0.725,0.697和0.693)。
(編譯 佟琳琳 審校 宋娜 劉云鵬)
