高級(jí)別漿液性卵巢癌分子亞型的專(zhuān)家共識(shí)
加拿大瑪嘉烈公主癌癥中心Chen等報(bào)告,新的卵巢癌亞型分類(lèi)共識(shí)綜合了多種分類(lèi)方法的觀點(diǎn),同時(shí)強(qiáng)調(diào)了分類(lèi)方法中無(wú)需將所有腫瘤歸于不同亞型的重要性。(Clin Cancer Res. 2018年8月29日在線(xiàn)版 doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-0784)
高級(jí)別漿液性癌(HGSOC)是卵巢癌中最常見(jiàn)的組織學(xué)類(lèi)型,該組織病理類(lèi)型與不良預(yù)后相關(guān)。手術(shù)和化療是其主要治療方法,同時(shí)腫瘤的分子特征將指導(dǎo)臨床專(zhuān)家選擇靶向治療方式。為此,許多專(zhuān)家提出了多種算法來(lái)對(duì)HGSOC進(jìn)行基因亞型分型,但是這些算法的一致性和穩(wěn)健性仍未知。
在本項(xiàng)研究中,研究者對(duì)公開(kāi)平臺(tái)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行了薈萃分析,對(duì)三種主要亞型分類(lèi)方法進(jìn)行了評(píng)估,并分析亞型分類(lèi)方法的穩(wěn)健性和一致性是否達(dá)統(tǒng)計(jì)學(xué)標(biāo)準(zhǔn)。基于多種算法的一致結(jié)果,研究者建立了腫瘤亞型分類(lèi)共識(shí),并可輸出置信度分?jǐn)?shù)。此外,利用表達(dá)數(shù)據(jù)概要,還可檢測(cè)出無(wú)法歸入已知分類(lèi)的腫瘤亞型。
研究數(shù)據(jù)顯示:HGSOC亞型分類(lèi)法呈現(xiàn)中等程度匹配的一致性(58.9%~70.9%,P<10-5),并且在數(shù)據(jù)集薈萃分析中與總生存相關(guān)(P<10-5)。目前,在多個(gè)數(shù)據(jù)集中各亞型的再聚類(lèi)分析的穩(wěn)定性尚未達(dá)統(tǒng)計(jì)學(xué)標(biāo)準(zhǔn)(預(yù)測(cè)強(qiáng)度<0.6)。在分類(lèi)一致的腫瘤樣本訓(xùn)練集中,這種新的亞型分類(lèi)法能獲得一致的分類(lèi)結(jié)果,且與患者年齡、生存、腫瘤純度和淋巴細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)。
(編譯 倪孟冬 審校 吳小華)
復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院 吳小華教授述評(píng):
卵巢癌是一種基因組變化復(fù)雜及高異質(zhì)性的癌種,因而通過(guò)其基因表達(dá)情況來(lái)準(zhǔn)確判斷表征不同亞型是十分困難的。但推動(dòng)腫瘤分子分型對(duì)于臨床實(shí)踐應(yīng)用價(jià)值巨大,PARP抑制劑在同源重組修復(fù)缺陷腫瘤中的應(yīng)用即為分子分型價(jià)值提供了良好佐證。通過(guò)了解不同亞型的生物學(xué)機(jī)制,臨床工作者將為患者提供更加具有針對(duì)性的治療。
