最大規(guī)模外顯子組分析顯示高外顯率基因突變頻率低
英國癌癥研究所Turnbull等報告的迄今對富集乳腺癌進(jìn)行的最大的病例對照全外顯子組分析顯示,雖然可能存在額外的乳腺癌易感基因,但高外顯率的基因突變頻率可能非常低。關(guān)于這些基因的臨床效用尚存爭議。(Ann Oncol. 2022年9月17日在線版 doi: 10.1016/j.annonc.2022.09.152)
乳腺癌有顯著的遺傳基礎(chǔ),但其中約60%仍無法解釋。檢測BRCA1/BRCA2可有效區(qū)分家族內(nèi)的乳腺癌風(fēng)險,而識別其他乳腺癌易感基因可提供臨床效用。
BOCS研究是英國一項(xiàng)關(guān)于家族性乳腺癌的回顧性研究。入組標(biāo)準(zhǔn)為:女性;BRCA陰性;歐洲白種人;以及具有以下條件之一,乳腺癌家族史,雙側(cè)疾病,發(fā)病年齡較小(<30歲),合并卵巢癌。
研究者通過BOCS研究納入了2135例浸潤性乳腺癌病例,進(jìn)行了外顯子測序,并與來自gnomAD的51 377名種族匹配的對照人群進(jìn)行了罕見破壞性變異體的基因水平負(fù)荷檢測。
在一個已知的乳腺癌易感基因中,7.4%(159/2135)的患者有一個符合條件的變異體,而在其他癌癥易感基因中幾乎沒有信號證據(jù)。
已知的乳腺癌易感基因PALB2、CHEK2和ATM是多重檢驗(yàn)校正后唯一保留統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的基因。由于該系列中遺傳病例富集,因此有良好的統(tǒng)計(jì)學(xué)把握度(>80%)來檢測BRCA1樣風(fēng)險(OR=10.6),包括群體最小等位基因頻率為4.6×10-5(1/10 799,小于BRCA1的1/10)的突變,以及檢測PALB2樣風(fēng)險(OR=5.0),也包括群體最小等位基因頻率為2.8×10-4(1/1779,小于PALB2的一半)的突變。對于新的中等外顯率基因(OR為2~3),如CHEK2和ATM,檢驗(yàn)把握度較低。
(編譯 楊潔安)
