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基因組分析揭示胰腺腺泡細(xì)胞癌的種系易感性和同源重組缺陷

作者: 來源: 發(fā)布時間:2023-10-17

美國紀(jì)念斯隆·凱特林癌癥中心Mandelker等報告的一項大型泛癌癥隊列顯示,胰腺腺泡細(xì)胞癌(PACC)被確定為BRCA2種系致病變異和HRD基因組特征患病率最高的癌癥類型,這表明PACC應(yīng)被視為BRCA相關(guān)惡性腫瘤譜系的一部分。(J Clin Oncol. 2023年8月22日在線版)

該研究的目的是探討PACC的遺傳易感性及其基因組特征;使用美國食品和藥物管理局授權(quán)的匹配腫瘤/正常測序法對28 780例癌癥患者進(jìn)行了體細(xì)胞和種系分析,其中49例被診斷為PACC。對于一部分PACC患者,研究者進(jìn)行了全基因組測序(WGS;12例)和RNA測序(6例)。

49例PACC中有18例(36.7%)攜帶同源重組(HR)和DNA損傷反應(yīng)(DDR)基因的種系致病變異,包括BRCA1(1例)、BRCA2(12例)、PALB2(2例)、ATM(2例)和CHEK2(1例)。31例PACC顯示為單純的腺泡細(xì)胞組織學(xué)類型,18例PACC為攜帶混合腺泡細(xì)胞組織學(xué)類型。

31例純PACC中有15例(48%)攜帶影響HR相關(guān)/DDR相關(guān)基因的種系致病變異。BRCA2種系致病變異(11/31,35%)在純PACC中的發(fā)生率明顯高于在胰腺腺癌(86/2739,3.1%;P<0.001)、高級別漿液性卵巢癌(67/1318,5.1%;P<0.001)、前列腺癌(116/3401,3.4%;P<0.001)、乳腺癌(79/3196,2.5%;P<0.001)中的發(fā)生率。

在進(jìn)行WGS的12例PACC中,有7例檢測到HR缺陷(HRD)的基因組特征,包括所有6例存在種系HR相關(guān)致病性突變的PACC患者,6例HR相關(guān)基因缺乏已知致病性改變PACC患者中的1例。探索性分析顯示,在PACC中,所有的體細(xì)胞驅(qū)動遺傳改變和高結(jié)合親和力的新抗原的負(fù)荷情況,均受HR相關(guān)/DDR相關(guān)基因和/或HRD的種系致病改變的影響。

(編譯 高媛)