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肝細(xì)胞癌 人工智能病理學(xué)可助力標(biāo)志物篩選

作者: 來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-11-29

法國研究者Zeng等報(bào)告的多中心回顧性研究表明,應(yīng)用于肝細(xì)胞癌數(shù)字載玻片的人工智能(AI)能作為阿替利珠單抗-貝伐珠單抗治療患者無進(jìn)展生存期的預(yù)測生物標(biāo)志物。這種方法可用于開發(fā)能廉價(jià)和快速檢測靶向治療的生物標(biāo)志物。人工智能熱圖與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的結(jié)合能洞察預(yù)測相關(guān)分子特征。這種方法可以應(yīng)用于其他癌癥或疾病,并提高對(duì)驅(qū)動(dòng)治療反應(yīng)的生物學(xué)機(jī)制的理解。(Lancet Oncol. 2023年11月8日在線版)

阿替利珠單抗(Atezolizumab)聯(lián)合貝伐珠單抗的臨床獲益僅在一小部分肝細(xì)胞癌患者中被觀察到,需要開發(fā)生物標(biāo)志物來改進(jìn)治療策略。通過分子生物學(xué)分析技術(shù)評(píng)估的阿替利珠單抗-貝伐珠單抗反應(yīng)特征(ABRS)已被證明與治療開始后的無進(jìn)展生存期相關(guān)。本研究的主要目的是開發(fā)一種人工智能模型,能直接從組織切片中估計(jì)ABRS的表達(dá),并評(píng)估模型預(yù)測是否與無進(jìn)展生存期相關(guān)。

在這項(xiàng)多中心回顧性研究中,研究者建立了一個(gè)模型(ABRS-P)。使用來自癌癥基因組圖譜的多中心數(shù)據(jù)集(接受手術(shù)切除治療的患者,336例)訓(xùn)練模型以擬合回歸分析。ABRS-P模型在來自肝細(xì)胞癌患者的兩個(gè)獨(dú)立系列樣本中進(jìn)行了外部驗(yàn)證(一個(gè)手術(shù)切除系列,225例;活檢系列,157例)。

該模型的預(yù)測價(jià)值在一系列多中心肝細(xì)胞癌患者的活檢樣本中得到進(jìn)一步檢驗(yàn),這些患者接受了阿替利珠單抗-貝伐珠單抗治療(122例)。研究中的所有樣本均來自成年人(年齡≥18歲)。驗(yàn)證集的采樣時(shí)間為2008年1月1日至2023年1月1日。

對(duì)于多中心驗(yàn)證集,主要目的是評(píng)估高ABRS-P值對(duì)比低ABRS-P值與治療開始后的無進(jìn)展生存期的相關(guān)性。最后,研究進(jìn)行了空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,并將預(yù)測熱圖與原位表達(dá)譜相匹配。

在840例患者中,男性641例(76%),女性199例(24%)。在整個(gè)開發(fā)和驗(yàn)證數(shù)據(jù)集中,肝細(xì)胞癌的危險(xiǎn)因素包括酒精攝入、乙型和丙型肝炎病毒感染以及非酒精性脂肪性肝炎。

在開發(fā)序列中進(jìn)行交叉驗(yàn)證,ABRS-P值與ABRS評(píng)分(ABRS基因的平均表達(dá)量)間Pearson相關(guān)性系數(shù)r的平均值為0.62(標(biāo)準(zhǔn)差SD為0.09;平均值,P<0.0001;SD,P<0.0001)。ABRS-P在外部驗(yàn)證系列總體來說表現(xiàn)良好(手術(shù)切除系列,r=0.60,95%CI 0.51~0.68,P<0.0001;活檢系列,r=0.53,95%CI 0.40~0.63,P<0.0001)。

在122例接受阿替利珠單抗-貝伐珠單抗治療治療的患者中,治療開始后,高ABRS-P腫瘤患者(74例)的中位無進(jìn)展生存期明顯長于低ABRS-P腫瘤患者的(48例;12個(gè)月 vs. 7個(gè)月,P=0.014)??臻g轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析顯示,在ABRS-P值高的腫瘤區(qū)域,與ABRS-P值低的腫瘤區(qū)域相比,ABRS評(píng)分明顯更高,其他各種免疫效應(yīng)物也上調(diào)。

(編譯 魏來)