美國研究者Schafer等報告，在非洲血統(tǒng)和歐洲血統(tǒng)的男性前列腺癌患者中，某些蛋白質(zhì)基因組學(xué)特征與該疾病較高的轉(zhuǎn)移風(fēng)險和（或）復(fù)發(fā)風(fēng)險相關(guān)。歐洲血統(tǒng)患者對比非洲血統(tǒng)患者，腫瘤中蛋白質(zhì)豐度和拷貝數(shù)改變（CNA）之間具有更強(qiáng)的相關(guān)性，表明CNA改變具有功能差異。（2024年AACR年會. 摘要號LB285/1）

蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)相結(jié)合的研究是一個被稱為蛋白質(zhì)基因組學(xué)的研究領(lǐng)域。蛋白質(zhì)基因組學(xué)研究的優(yōu)勢在于它可以同時檢查DNA和蛋白質(zhì)，以幫助了解錯誤發(fā)生在哪里。因為每個人的DNA都略有不同，這有望使人們對前列腺癌有更精確的了解。

前列腺癌的基因組圖譜因患者血統(tǒng)來源而異，但很少有研究對比非洲血統(tǒng)和歐洲血統(tǒng)匹配的患者隊列中蛋白質(zhì)基因組學(xué)特征與全面的臨床病理數(shù)據(jù)和長期隨訪結(jié)局。

該項多組學(xué)分析自美國軍隊衛(wèi)生系統(tǒng)納入57例非洲血統(tǒng)和55例歐洲血統(tǒng)的、有平等機(jī)會接受治療的前列腺癌患者組織標(biāo)本構(gòu)成了一個隊列，使用全基因組深度測序技術(shù)、基于蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸蛋白質(zhì)組學(xué)的定量質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行分析。

結(jié)果顯示，在基因組譜、差異化的蛋白質(zhì)組譜和磷酸蛋白質(zhì)組譜中，發(fā)現(xiàn)了血統(tǒng)相關(guān)的體細(xì)胞突變特征，包括單核苷酸變異（SNV）、結(jié)構(gòu)變異（SV）、插入缺失（InDel），以及復(fù)發(fā)性SNV和CNA。

17p13缺失和1p36擴(kuò)增的最大檢出率分別見于歐洲血統(tǒng)和非洲血統(tǒng)的腫瘤樣本中。在歐洲血統(tǒng)腫瘤樣本的3p、17p和18q染色體上，在非洲血統(tǒng)腫瘤樣本的1q、3q、5q、13q和19p染色體上，驅(qū)動基因的SNV和CNA改變均更常見。

蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，在非洲血統(tǒng)腫瘤樣本中，調(diào)節(jié)雄激素信號傳導(dǎo)、脂肪酸氧化和異生素代謝的途徑均上調(diào)。研究者鑒定并驗證了一個ERG反應(yīng)蛋白組，該蛋白組能顯著區(qū)分出TMPRSS2-ERG融合和ERG表達(dá)。

單變量分析發(fā)現(xiàn)了與更高的術(shù)后生化復(fù)發(fā)（BCR）和（或）轉(zhuǎn)移風(fēng)險相關(guān)的、蛋白質(zhì)表達(dá)和復(fù)發(fā)性CNA的新特征。非洲和歐洲患者腫瘤中某些與生化復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移風(fēng)險相關(guān)的蛋白表達(dá)水平存在差異。例如，氧化磷酸化途徑中的幾種NADH:泛醌還原酶亞單位蛋白（如NDUFS8和NDUFV3）在非洲血統(tǒng)患者的腫瘤中表達(dá)水平較高，膽固醇代謝途徑中的幾種載脂蛋白（如APOB和APOC1）在歐洲血統(tǒng)患者的腫瘤中表達(dá)增加。在歐洲血統(tǒng)患者的樣本中，與衰老相關(guān)的突變信號更高；非洲血統(tǒng)患者的樣本中，與DNA修復(fù)缺陷相關(guān)的信號表達(dá)更高。

研究者表示，這些血統(tǒng)來源的差異和基因突變特征的變化可以部分解釋為什么一些癌癥比另一些癌癥更具侵襲性，并可以揭示癌細(xì)胞的弱點，這些癌細(xì)胞可以作為治療的目標(biāo)。

該研究的局限性包括樣本量相對較小，以及每個隊列中患者平均診斷年齡之間的不平衡性，因為納入的非洲裔男性往往在更年輕的時候就被確診。此外，腫瘤樣本來自早期疾病患者，因此研究結(jié)果沒有反映出晚期或轉(zhuǎn)移性前列腺癌中所見的更多樣的突變特征。

（編譯 鄭嘉瑞）