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北京大學腫瘤醫(yī)院

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全基因組ctDNA測序可用于乳腺癌檢測

作者: 來源: 發(fā)布時間:2025-04-02

英國倫敦癌癥研究所Turner等報告,一項基于分子殘留?。∕RD)的全基因組測序能檢測乳腺癌復發(fā),其領先時間(lead time)比臨床復發(fā)要長,并且與無復發(fā)生存期強烈相關。診斷時ctDNA檢出率高于基于外顯子組測序的腫瘤檢測報告。(Ann Oncol. 2025年2月4日在線版)

基于循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)的MRD檢測提供了一種識別復發(fā)高風險患者的策略。在此,研究者用一個超敏感的、基于全基因組測序的、知曉腫瘤信息的ctDNA平臺來分析早期乳腺癌患者。

該研究分析了78例患者的617份血漿樣本(23例三陰性乳腺癌,35例HER2陽性,18例HR陽性,2例未知),在治療前的診斷時、新輔助化療(NAC)的第2周期、新輔助治療手術后(如可行)、第一年的每3個月、之后每6個月都進行樣本采集,使用NeXT個人MRD平臺分析血漿DNA(這是一種腫瘤信息全基因組測序方法,可產(chǎn)生個性化的ctDNA測序面板),追蹤每例患者的中位1451個變體。分析MRD檢測與臨床結局的關系。

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以百萬之一(PPM)為計量單位,樣本中ctDNA的檢測水平范圍為2.19 PPM至204 900 PPM,中位數(shù)為405 PPM,其中39%的所有ctDNA檢測在<100 PPM的超低范圍內(nèi)。在診斷時有樣本的患者中,98%(49/50)在治療前檢測到ctDNA。

中位隨訪76個月時,ctDNA檢測與未來復發(fā)的高風險(對數(shù)秩檢驗,P<0.0001)和總生存期縮短(P<0.0001)相關,從ctDNA檢測到臨床復發(fā)的中位領先時間為15個月(0.9~61.5個月)。100%(11/11)的復發(fā)患者發(fā)現(xiàn)了MRD,首次MRD檢測時ctDNA的中位水平為13.1 PPM。隨訪期間未檢測到ctDNA的患者無復發(fā)(64/64)。與基于外顯子組測序MRD分析相比,該方法的敏感性和領先時間均有所改善。

 (編譯 胡一凡)