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胰腺癌 cfDNA片段組學(xué)早期檢測(cè)模型研究

作者: 來源: 發(fā)布時(shí)間:2025-05-28

南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院蔣奎榮教授等報(bào)告的一項(xiàng)研究強(qiáng)調(diào)了游離細(xì)胞DNA(cfDNA)片段組學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)在胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)早期檢測(cè)中的有效性。該方法有望通過早期干預(yù)降低PDAC患者的死亡率,并可作為腫瘤診斷的突破。(J Clin Oncol. 2025年5月1日在線版)

PDAC以其高死亡率而聞名,通常在不可手術(shù)的晚期才被診斷出來。這突出了對(duì)創(chuàng)新和有效的早期檢測(cè)技術(shù)的迫切需要。本研究的重點(diǎn)是利用cfDNA片段組學(xué)整合先進(jìn)的機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),以高精度識(shí)別早期PDAC。

該研究包括1167名參與者的廣泛隊(duì)列,從中收集血漿并進(jìn)行低深度全基因組測(cè)序。經(jīng)過嚴(yán)格的質(zhì)量評(píng)估,166例診斷為PDAC的個(gè)體和167名健康參與者被納入訓(xùn)練隊(duì)列,而驗(yàn)證隊(duì)列由112例PDAC患者和111名健康個(gè)體組成。另一組67例非惡性胰腺囊腫患者也被納入其中,以驗(yàn)證模型的準(zhǔn)確性。最后,兩個(gè)額外的外部驗(yàn)證隊(duì)列和一個(gè)額外的獨(dú)立早期數(shù)據(jù)集被用來評(píng)估模型的穩(wěn)健性。該分析使用片段組分析,整合拷貝數(shù)變化、片段大小、突變特征和使用機(jī)器學(xué)習(xí)分析的甲基化模式。

該模型在區(qū)分PDAC患者和對(duì)照組方面具有顯著的準(zhǔn)確性,訓(xùn)練數(shù)據(jù)集的AUC為0.992,驗(yàn)證數(shù)據(jù)集的AUC為0.987。在閾值為0.52時(shí),訓(xùn)練集的敏感性為93.4%,特異性為95.2%。在驗(yàn)證數(shù)據(jù)集中,敏感性為97.3%,特異性為92.8%,而外部數(shù)據(jù)集的敏感性為90.91%,特異性為94.5%。

(編譯 鄧旭)

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