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北京大學(xué)腫瘤醫(yī)院

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研究發(fā)現(xiàn)增強(qiáng)子RNA可預(yù)測(cè)免疫治療療效

作者: 來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2025-05-28

復(fù)旦大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院張朝、劉秀萍等研究發(fā)現(xiàn),利用增強(qiáng)子RNA(eRNA)在腫瘤免疫微環(huán)境中的特性,建立了eRNA免疫治療預(yù)測(cè)分?jǐn)?shù) (eRIS),eRIS可用來(lái)表征免疫治療的反應(yīng)率和預(yù)測(cè)提高免疫治療反應(yīng)的聯(lián)用藥物,顯示良好的臨床應(yīng)用潛力。(Cancer Res. 2025,85:1530.)

激活狀態(tài)的增強(qiáng)子會(huì)轉(zhuǎn)錄出一段非編碼RNA,即eRNA,它們?cè)诨虮磉_(dá)調(diào)控中扮演重要角色。eRNA有較高的組織和細(xì)胞特異性,與腫瘤微環(huán)境中免疫細(xì)胞的浸潤(rùn)密切相關(guān)。eRNA與多種抗癌藥物的敏感性存在聯(lián)系。系統(tǒng)地研究eRNA在腫瘤免疫治療中的功能,對(duì)于在大規(guī)模腫瘤患者中篩選聯(lián)合治療藥物有重要意義。

研究者通過(guò)綜合分析來(lái)自超過(guò)10 000個(gè)TCGA樣本的eRNA表達(dá)數(shù)據(jù)與腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞的豐度,發(fā)現(xiàn)eRNA的表達(dá)與免疫細(xì)胞類型的分布關(guān)系,揭示了eRNA通過(guò)與腫瘤免疫細(xì)胞的相互作用,能促進(jìn)腫瘤免疫反應(yīng)的強(qiáng)化,特別是在腫瘤免疫微環(huán)境中發(fā)揮重要調(diào)節(jié)作用。研究者進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),這為eRNA在免疫治療中的應(yīng)用提供了理論基礎(chǔ)。某些eRNA在免疫細(xì)胞中的表達(dá)變化可能是腫瘤免疫逃逸的關(guān)鍵因素,

研究者開(kāi)發(fā)了eRNA免疫治療標(biāo)志物(eRIS)系統(tǒng),這一評(píng)分系統(tǒng)能精準(zhǔn)預(yù)測(cè)免疫治療的反應(yīng)效果,即高eRIS的患者在接受免疫治療時(shí)表現(xiàn)出更好的反應(yīng)率。研究結(jié)果表明,eRIS不僅能有效區(qū)分免疫治療響應(yīng)良好的患者與不良反應(yīng)患者,還能為免疫治療方案的個(gè)性化制定提供依據(jù)。

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通過(guò)對(duì)eRIS與免疫治療藥物的藥物敏感性進(jìn)行相關(guān)性分析,研究者預(yù)測(cè)了潛在提高免疫治療反應(yīng)率的聯(lián)用藥物。并在低級(jí)別膠質(zhì)瘤(LGG)IDH突變型和IDH野生型腫瘤中,分析了vorinostat與anti-PD-1這一聯(lián)合治療的療效,明確了聯(lián)合治療相比單藥組和安慰劑組不僅能顯著提高免疫細(xì)胞的浸潤(rùn),抑制腫瘤生長(zhǎng),還能顯著提高小鼠的存活率。

針對(duì)免疫細(xì)胞豐度變化的分析顯示,聯(lián)合治療組的CD8+ T細(xì)胞、CD3+細(xì)胞、CD45+細(xì)胞和IBA1+細(xì)胞的豐度均顯著增加,證實(shí)了腫瘤微環(huán)境中T細(xì)胞和巨噬細(xì)胞豐度的增加,驗(yàn)證了eRIS作為免疫治療反應(yīng)標(biāo)志物的有效性,特別是在腫瘤微環(huán)境中eRIS能準(zhǔn)確反映免疫細(xì)胞在腫瘤微環(huán)境中的變化。這一特性為eRIS在臨床中的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ),為未來(lái)免疫治療的個(gè)體化精準(zhǔn)醫(yī)療提供了新的思路。

研究者致力于整合計(jì)算生物學(xué)與多組學(xué)方法,探索健康及復(fù)雜疾病組織中關(guān)鍵調(diào)控分子與遠(yuǎn)端調(diào)控元件的動(dòng)態(tài)變化與功能機(jī)制,該研究是使用eRNA輔助腫瘤免疫治療方面的首次嘗試。

(編譯 韓婧)