生物質(zhì)譜技術(shù)平臺管理細(xì)則
1. 生物質(zhì)譜平臺儀器如下:
●基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜 MALDI-TOF/TOF (Bruker Daltonics UltraFlex III)
●液相色譜-四級桿-飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜儀(micrOTOFQ II LC/MS QTOF)(nanoLC:Dionex;MS:Bruker Daltonics)
2. 本平臺在滿足本院研究人員需求的同時,也對兄弟院校開放檢測。
3. 為保證大型高精度實(shí)驗(yàn)儀器的順利運(yùn)行,本平臺實(shí)行專人負(fù)責(zé)操作、維護(hù)及管理。儀器負(fù)責(zé)人需通過該平臺儀器的專業(yè)培訓(xùn)并獲相關(guān)資質(zhì)方可上機(jī)操作。不開放他人上機(jī)操作。
4. 本平臺實(shí)行儀器使用登記制度,記錄儀器使用日期、儀器狀態(tài)、樣品名稱及使用人。
5. 儀器原則上365天24小時開機(jī),如遇特殊情況,負(fù)責(zé)人應(yīng)嚴(yán)格按照儀器開關(guān)機(jī)程序操作。
6. 儀器負(fù)責(zé)人應(yīng)維持質(zhì)譜儀及周圍環(huán)境的潔凈,定期檢查環(huán)境的溫度和濕度、氮?dú)獾膲毫?、泵油的狀態(tài)、濾網(wǎng)的潔凈度、清洗噴霧相關(guān)配件、清空廢液瓶等。
7. 申請使用
樣品送檢需提前預(yù)約。申請人需認(rèn)真查看“送樣須知”后填寫“使用申請單”,注明申請單位及科室以及課題名稱等,并附樣品來源、濃度及相關(guān)信息僅收取成本費(fèi)。(“使用須知”及“使用申請單”可在預(yù)約時找平臺負(fù)責(zé)人領(lǐng)取)。
8. 數(shù)據(jù)管理
實(shí)驗(yàn)結(jié)果根據(jù)申請人要求可以打印報告、E-mail或者刻錄光盤形式發(fā)送,本平臺只保存實(shí)驗(yàn)結(jié)果六個月。
聯(lián)系人:沈靖、田慧芳 聯(lián)系電話:88196715/6720
地點(diǎn):科研樓612室
附:
生物質(zhì)譜技術(shù)平臺使用須知
1. 基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(Ultraflex III? MALDI TOF /TOF)
MALDI-TOF-MS)是近年來發(fā)展起來的一種新型的軟電離生物質(zhì)譜。適用于混合物及生物大分子的測定。MALDI-TOF-MS具有靈敏度高、準(zhǔn)確度高及分辨率高等特點(diǎn),為生命科學(xué)等領(lǐng)域提供了一種強(qiáng)有力的分析測試手段。該平臺是新一代標(biāo)準(zhǔn)模塊化飛行時間質(zhì)譜儀,具有smartbeam?激光技術(shù),配有MALDI離子源、線性和反射操作模式、源后裂解(PSD)串聯(lián)質(zhì)譜和高能量碰撞誘導(dǎo)解離 (CID)。
主要用途:
●結(jié)合磁珠即液體芯片用于從復(fù)雜體液發(fā)現(xiàn)潛在的生物標(biāo)志物
●蛋白質(zhì)樣品分子量測定
●肽質(zhì)量指紋圖譜(Peptide Mass Fingerprinting, PMF)分析
●多肽序列測定
●蛋白質(zhì)的磷酸化、糖基化等翻譯后修飾分析
●寡核苷酸多態(tài)性分析
2. 液相色譜-四級桿-飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜儀(micrOTOFQ II LC/MS QTOF)
micrOTOFQ II 屬于四級桿-飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜(Q-TOF MS)類質(zhì)譜。其主要組成部分包括電噴霧離子漏斗源、四級桿、TOF質(zhì)量分析器、注射泵和數(shù)據(jù)采集與處理部分。該質(zhì)譜與液相色譜聯(lián)用自動進(jìn)樣,適合于多肽的分離、檢測與測序,可應(yīng)用在大規(guī)模藥物開發(fā)、蛋白質(zhì)組學(xué)等新興技術(shù)領(lǐng)域。
主要用途:
●蛋白質(zhì)樣品分子量測定
●精確質(zhì)量測定及元素組成分析
●肽質(zhì)量指紋譜
●多肽序列測定
●蛋白質(zhì)的磷酸化、糖基化等翻譯后修飾分析
●與二維液相相聯(lián),可進(jìn)行多肽的分離、檢測與測序
送樣須知
蛋白樣品鑒定:
1. 樣品量:50pmol干粉或1ug/uL以上(一般測試)
100pmol干粉或1ug/uL以上(MALDI串聯(lián)質(zhì)譜分析)
2. 鹽含量:揮發(fā)性無機(jī)鹽<20mM,請勿使用PBS、SDS和尿素等質(zhì)譜干擾物質(zhì);
3. 銀染過程中不得使用戊二醛作為固定劑;
4. 電泳過程中,請操作者戴口罩、帽子、無粉手套,以防止角蛋白污染;
5. 送樣時,請?zhí)峁悠沸畔ⅲ悠访Q、膠圖、分子量大小、種屬等。
生物標(biāo)志物分析:
1. 適于分析各種體液(血液、尿液、胃液、前列腺液及乳頭分泌液等)及蛋白提取液,蛋白提取液應(yīng)統(tǒng)一進(jìn)行蛋白定量。
2. 統(tǒng)一規(guī)范取樣過程,血清樣本的收集和保存方法如下:
(1)使用BD真空抽血管(不抗凝)清晨空腹抽血2-5ml,半小時內(nèi)放入4℃冰箱保存,4℃3000轉(zhuǎn)離心5分鐘。取上清加入eppendorf管。再次3000轉(zhuǎn)離心5分鐘,0.5ml eppendorf管分裝,20μl/管,放入-80℃保存,每個樣本至少3管以上(以備重復(fù)檢測)。
(2)血清樣本在離體4小時內(nèi),應(yīng)完成離心、分裝等過程,并放入-80℃保存。期間所有操作均在4℃以下進(jìn)行,所有樣本保證只凍融一次。
注:樣本不能有溶血,不能將下層的細(xì)胞吸入,不能吸入上層油脂;操作時不要戴有粉乳膠手套,以免滑石粉干擾對樣品的檢測。
3. 樣本應(yīng)標(biāo)記清楚,材料齊全。
4. 實(shí)驗(yàn)耗材的統(tǒng)一 為保證樣品的質(zhì)量及條件的統(tǒng)一,對耗材要求如下:
Pipet Tips(Axygen公司)
Eppendorf 管 (Axygen公司)
BD真空抽血管(不抗凝)(BD公司)
5. 每周一至周五,請?zhí)崆?-2周預(yù)約。
