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CDKN2A基因拷貝缺失定量檢測(cè)方法獲得中國(guó)和美國(guó)發(fā)明專利授權(quán)
近日，由病因?qū)W研究室鄧大君教授等申報(bào)的國(guó)際發(fā)明專利“定量檢測(cè)人CDKN2A基因拷貝缺失的方法、引物及其用途”獲得了美國(guó)專利局的授權(quán)（專利號(hào)US20220275454B2）。該專利在2024年6月4日亦獲得中國(guó)專利授權(quán)（專利號(hào)CN201980096165.4）。
CDKN2A/P16基因不僅會(huì)通過(guò)DNA甲基化途徑發(fā)生表觀遺傳失活，還會(huì)通過(guò)體細(xì)胞基因拷貝數(shù)缺失（SCNdel）途徑失活。在人泛腫瘤基因組中CDKN2A/P16是拷貝數(shù)變異頻率最高的腫瘤抑制基因，在食管鱗癌中該基因SCNdel的發(fā)生頻率高達(dá)65%。然而因?yàn)镈NA片段缺失位置多樣，目前對(duì)腫瘤抑制基因拷貝數(shù)缺失研究和認(rèn)識(shí)非常不足，導(dǎo)致包括CDKN2A基因在內(nèi)的各種腫瘤抑制基因的便利、可靠的檢測(cè)方法缺乏，臨床轉(zhuǎn)化研究受阻。
鄧大君教授研究團(tuán)隊(duì)長(zhǎng)期研究該基因失活與腫瘤發(fā)生發(fā)展的關(guān)系及其應(yīng)用研究，近年他們?cè)谀[瘤細(xì)胞基因組CDKN2A基因拷貝缺失規(guī)律、生物學(xué)意義、臨床檢測(cè)方法建立、臨床用途等方面取得了新的突破。他們發(fā)現(xiàn)在CDKN2A基因發(fā)生拷貝缺失的人類腫瘤中，超過(guò)95%的樣品存在一個(gè)5.1kb的共同缺失序列；該序列的缺失可導(dǎo)致該基因編碼的2個(gè)蛋白P16(ink4a)和P14(arf)完全缺失和截?cái)嗤蛔儭Ｒ栽摴餐笔蛄袨榘袠?biāo)，他們創(chuàng)建了定量PCR法測(cè)定該基因拷貝數(shù)的新方法（P16-Light，F(xiàn)ront Oncol 2022, 12: 1038380；國(guó)際發(fā)明專利授權(quán)）。通過(guò)與國(guó)家癌癥中心魏文強(qiáng)教授合作開展多中心前瞻隊(duì)列研究，他們發(fā)現(xiàn)CDKN2A SCNdel會(huì)顯著增加癌前病變食管鱗狀上皮異型增生的癌變風(fēng)險(xiǎn)；還意外發(fā)現(xiàn)該基因還會(huì)發(fā)生拷貝擴(kuò)增（SCNamp），能夠顯著促進(jìn)食管癌前病變消退（Chinese Med J 2024, 137: 980-989）。他們還發(fā)現(xiàn)胃癌組織的CDKN2A SCNdel促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖和侵襲及血行轉(zhuǎn)移（Front Oncol 2021, 11: 801219），而切緣非癌組織的CDKN2A SCNamp則明顯降低胃癌轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)，延長(zhǎng)患者總生存時(shí)間（Gastric Cancer 2024, 27:986-997）。這些結(jié)果說(shuō)明CDKN2A基因拷貝數(shù)變異發(fā)生在細(xì)胞癌變?cè)缙?，在判斷癌前病變癌變潛能和腫瘤復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移上有重要臨床應(yīng)用前景。
目前鄧大君教授研究團(tuán)隊(duì)正致力于CDKN2A拷貝數(shù)變異體外診斷試劑盒的開發(fā)工作，以期早日服務(wù)于臨床患者。
