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CDKN2A基因拷貝缺失定量檢測方法獲得中國和美國發(fā)明專利授權
近日，由病因?qū)W研究室鄧大君教授等申報的國際發(fā)明專利“定量檢測人CDKN2A基因拷貝缺失的方法、引物及其用途”獲得了美國專利局的授權（專利號US20220275454B2）。該專利在2024年6月4日亦獲得中國專利授權（專利號CN201980096165.4）。
CDKN2A/P16基因不僅會通過DNA甲基化途徑發(fā)生表觀遺傳失活，還會通過體細胞基因拷貝數(shù)缺失（SCNdel）途徑失活。在人泛腫瘤基因組中CDKN2A/P16是拷貝數(shù)變異頻率最高的腫瘤抑制基因，在食管鱗癌中該基因SCNdel的發(fā)生頻率高達65%。然而因為DNA片段缺失位置多樣，目前對腫瘤抑制基因拷貝數(shù)缺失研究和認識非常不足，導致包括CDKN2A基因在內(nèi)的各種腫瘤抑制基因的便利、可靠的檢測方法缺乏，臨床轉(zhuǎn)化研究受阻。
鄧大君教授研究團隊長期研究該基因失活與腫瘤發(fā)生發(fā)展的關系及其應用研究，近年他們在腫瘤細胞基因組CDKN2A基因拷貝缺失規(guī)律、生物學意義、臨床檢測方法建立、臨床用途等方面取得了新的突破。他們發(fā)現(xiàn)在CDKN2A基因發(fā)生拷貝缺失的人類腫瘤中，超過95%的樣品存在一個5.1kb的共同缺失序列；該序列的缺失可導致該基因編碼的2個蛋白P16(ink4a)和P14(arf)完全缺失和截斷突變。以該共同缺失序列為靶標，他們創(chuàng)建了定量PCR法測定該基因拷貝數(shù)的新方法（P16-Light，F(xiàn)ront Oncol 2022, 12: 1038380；國際發(fā)明專利授權）。通過與國家癌癥中心魏文強教授合作開展多中心前瞻隊列研究，他們發(fā)現(xiàn)CDKN2A SCNdel會顯著增加癌前病變食管鱗狀上皮異型增生的癌變風險；還意外發(fā)現(xiàn)該基因還會發(fā)生拷貝擴增（SCNamp），能夠顯著促進食管癌前病變消退（Chinese Med J 2024, 137: 980-989）。他們還發(fā)現(xiàn)胃癌組織的CDKN2A SCNdel促進胃癌細胞增殖和侵襲及血行轉(zhuǎn)移（Front Oncol 2021, 11: 801219），而切緣非癌組織的CDKN2A SCNamp則明顯降低胃癌轉(zhuǎn)移風險，延長患者總生存時間（Gastric Cancer 2024, 27:986-997）。這些結(jié)果說明CDKN2A基因拷貝數(shù)變異發(fā)生在細胞癌變早期，在判斷癌前病變癌變潛能和腫瘤復發(fā)轉(zhuǎn)移上有重要臨床應用前景。
目前鄧大君教授研究團隊正致力于CDKN2A拷貝數(shù)變異體外診斷試劑盒的開發(fā)工作，以期早日服務于臨床患者。
