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腫瘤生物信息中心 - 吳健民

吳健民簡(jiǎn)介

吳健民，研究員、博士生導(dǎo)師、腫瘤生物信息中心主任，信息部副主任。2006年北京大學(xué)生物信息學(xué)博士畢業(yè)，在芬蘭赫爾辛基大學(xué)進(jìn)行了博士后研究（2006-2010）,然后在澳大利亞悉尼Garvan 醫(yī)學(xué)研究所擔(dān)任研究組長(zhǎng)(PI, 2006-2010)和新南威爾士大學(xué)兼職高級(jí)講師(2012-2016)。2016年2月在北京腫瘤醫(yī)院任職至今。吳健民研究員在癌癥基因組和蛋白組相關(guān)的生物信息學(xué)多個(gè)領(lǐng)域開(kāi)展了系列高水平的創(chuàng)新研究，開(kāi)發(fā)的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析平臺(tái)PINA獲得廣泛應(yīng)用，在此基礎(chǔ)上圍繞胰腺癌、食道腺癌等實(shí)體瘤的多組學(xué)研究, 為發(fā)現(xiàn)相關(guān)癌癥驅(qū)動(dòng)基因和信號(hào)通路的失常提供了重要的線索。截止2016年5月累計(jì)發(fā)表SCI論文35篇，其第一作者/通訊作者的工作發(fā)表在 Nature Reviews Cancer(2016, 封面文章，榮獲F1000Prime推薦)、Nature Methods (2009) 和Nucleic Acids Research (2006,…

吳健民研究員在癌癥基因組和蛋白組相關(guān)的生物信息學(xué)多個(gè)領(lǐng)域開(kāi)展了系列高水平的創(chuàng)新研究，開(kāi)發(fā)的蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析平臺(tái)PINA獲得廣泛應(yīng)用，在此基礎(chǔ)上圍繞胰腺癌、食道腺癌等實(shí)體瘤的多組學(xué)研究, 為發(fā)現(xiàn)相關(guān)癌癥驅(qū)動(dòng)基因和信號(hào)通路的失常提供了重要的線索。

截止2016年5月累計(jì)發(fā)表SCI論文35篇，其第一作者/通訊作者的工作發(fā)表在 Nature Reviews Cancer(2016, 封面文章，榮獲F1000Prime推薦)、Nature Methods (2009) 和Nucleic Acids Research (2006, 2009, 2012) 等國(guó)際專業(yè)高影響力雜志; 其合作研究也多次發(fā)表在Nature（2012, 2015, 2016)和Cell (2014)等國(guó)際一流雜志。這些工作獲得了澳大利亞 NHMRC、Cancer Council NSW和Vodafone Foundation等多個(gè)機(jī)構(gòu)的科研資助。2016年獲得北京市留學(xué)人員科技活動(dòng)項(xiàng)目擇優(yōu)資助(重點(diǎn)項(xiàng)目)。

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代表性著作 (*: corresponding author, §:equal contribution)

1. Fleuren ED, Zhang L, Wu J*, Daly RJ*. (2016) The kinome “at large” in cancer. Nature Reviews Cancer 16, 83-98. (封面文章, F1000Prime推薦)

2. Humphrey ES, Su SP, Nagrial AM, Hochgra?fe F, Pajic M, Lehrbach GM, Parton RG, Yap AS, Horvath LG, Chang DK, Biankin AV, Wu J*, Daly RJ* (2016) Resolution of novel pancreatic ductal adenocarcinoma subtypes by global phosphotyrosine profiling. Molecular & Cellular Proteomics. (in press)

3. Rajendra S*, Wang B*, Merrett N, Sharma P, Humphris J, Lee HC, Wu J*. (2016) Genomic analysis of HPV-positive versus HPV-negative oesophageal adenocarcinoma identifies a differential mutational landscape. Journal of Medical Genetics 53(4):227-231.

4. Cowley MJ, Pinese M, Kassahn KS, Waddell N, Pearson JV, Grimmond SM, Biankin AV, Hautaniemi S and Wu J* (2012) PINA v2.0: mining interactome modules. Nucleic Acids Research 40, D862-865.

5. Wu J*, Vallenius T, Ovaska K, Westermarck J, Makela TP, Hautaniemi S. (2009) Integrated network analysis platform for protein-protein interactions. Nature Methods 6, 75-77.

6. Wu J§, Mao X§, Cai T, Luo J* and Wei L*. (2006) KOBAS server: a web-based platform for automated annotation and pathway identification. Nucleic Acids Research 34, W720-724.

精選合作文章

7. Waddell N, Pajic M, Patch AM et al. (2015) Whole Genomes Redefine the Mutational Landscape of Pancreatic Cancer. Nature 518, 495-501.

8. Morran DC, Wu J, Jamieson NB et al. (2014) Targeting mTOR Dependency in Pancreatic Cancer. Gut 63, 1481-1489.

9. Weissmueller S, Manchado E, Saborowski M, Morris JP IV, Wagenblast E, Davis CA, Moon SH, Pfister NT, Tschaharganeh DF, Kitzing T, Aust D, Markert EK, Wu J, Grimmond SM, Pilarsky C, Prives C, Biankin AV, Lowe SW*. (2014) Mutant p53 Drives Pancreatic Cancer Metastasis through Cell-Autonomous PDGF Receptor β Signaling. Cell 157, 382-394.

10. Biankin AV, Waddell N, Kassahn K, Gingras M, Muthuswamy LB, Johns AL, Miller DK, Wilson PJ, Patch A, Wu J, et al. (2012) Pancreatic Cancer Genomes Reveal Aberrations in Axon Guidance Pathway Genes. Nature 491, 399-405.

聯(lián)系電話：010-88121122、88196358 科室位置：北京海淀區(qū)阜成路52號(hào)（定慧寺）

技術(shù)團(tuán)隊(duì)

吳健民

回復(fù)問(wèn)題 0 個(gè)

擅長(zhǎng)疾病

胰腺癌: 胰腺有內(nèi)分泌和外分泌兩種功能，也就有內(nèi)分泌和外分泌兩種細(xì)胞。這兩種細(xì)胞都會(huì)發(fā)生癌變，來(lái)源自內(nèi)分泌細(xì)胞的癌，叫神經(jīng)內(nèi)分泌癌，就是蘋果公司總裁喬布斯得的那種癌，比較少見(jiàn)，多數(shù)情況下惡性程度比較低，病程比較長(zhǎng)，治療方式與常見(jiàn)的胰腺癌也有所不同。來(lái)自外分泌細(xì)胞的癌，就是我們常說(shuō)的胰腺癌，是一種惡性程度比較高的腫瘤。多發(fā)生于中老年人，發(fā)達(dá)國(guó)家發(fā)病率高于發(fā)展中國(guó)家。隨著我國(guó)生活水平的提高和飲食結(jié)構(gòu)的改變，近年來(lái)胰腺癌的發(fā)病率呈現(xiàn)上升的趨勢(shì)，并且有年輕化的傾向。

所在科室

腫瘤生物信息中心

腫瘤生物信息中心成立于2016年，是個(gè)有著多學(xué)科背景的研究團(tuán)隊(duì)，目前包括研究員1名，助理研究員（生物信息）2名，項(xiàng)目助理研究員（蛋白質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)）1名，技術(shù)員（實(shí)驗(yàn)）1名。中心配備了高性能計(jì)算集群（760 個(gè) CPU 內(nèi)核、5.12 TB 內(nèi)存和 1.44 PB 存儲(chǔ)），具備大規(guī)模組學(xué)數(shù)據(jù)的分析和處理能力。中心主任吳健民研究員在癌癥基因組和蛋白組相關(guān)的生物信息學(xué)多個(gè)領(lǐng)域開(kāi)展了系列高水平的創(chuàng)新研…

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