一、 科室簡(jiǎn)介胃腸腫瘤生物學(xué)研究室成立于2016年9月7日，主要基于腫瘤組學(xué)研究，以轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)為研究方向，堅(jiān)持臨床與基礎(chǔ)研究相結(jié)合，致力于識(shí)別腫瘤的早診標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)，以延長(zhǎng)患者生存期。
二、 課題組主要研究工作
基因變異是腫瘤發(fā)生的關(guān)鍵事件也是腫瘤治療靶點(diǎn)的主要來(lái)源，盡管之前已有基于基因組測(cè)序識(shí)別胃癌突變基因的研究，但結(jié)果顯示，與其他癌腫不同，胃癌的突變基因是沒(méi)有突變熱點(diǎn)的，這使其不利于靶向藥物的研發(fā)。基因變異不僅來(lái)源于突變，還來(lái)源于拷貝數(shù)變異，但目前缺乏對(duì)胃癌結(jié)構(gòu)變異的系統(tǒng)研究。為此，我們采集了具有代表性的胃癌配對(duì)樣本，進(jìn)行了全基因組測(cè)序研究，并首次在國(guó)際上構(gòu)建了胃癌結(jié)構(gòu)變異圖譜。發(fā)現(xiàn)相對(duì)于基因突變，胃癌是以拷貝數(shù)擴(kuò)增為主的腫瘤。為了識(shí)別胃癌的治療靶點(diǎn)，我們首先分析了癌基因拷貝數(shù)擴(kuò)增的機(jī)制。結(jié)果發(fā)現(xiàn)除了常見(jiàn)的雙微粒、染色體危象等復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異外，相較于其他腫瘤，胃癌中存在較高頻率的串聯(lián)重復(fù)現(xiàn)象。串聯(lián)重復(fù)只會(huì)導(dǎo)致基因增加一個(gè)拷貝數(shù)，因此由該機(jī)制產(chǎn)生的癌基因常常被忽略。更為重要的是，我們發(fā)現(xiàn)在早期胃癌中，串聯(lián)重復(fù)可同時(shí)導(dǎo)致兩個(gè)或兩個(gè)以上個(gè)重要癌基因的擴(kuò)增，提示由串聯(lián)重復(fù)產(chǎn)生的癌基因在腫瘤發(fā)生過(guò)程中發(fā)揮了重要作用。為此我們著重分析了串聯(lián)重復(fù)，發(fā)現(xiàn)該基因?qū)е铝薍ER2、C-MYC等重要癌基因的拷貝數(shù)擴(kuò)增，同時(shí)我們還識(shí)別了一組包括ZFP36L2在內(nèi)的新的癌基因。
本實(shí)驗(yàn)室主要對(duì)這些新的癌基因基因功能機(jī)制研究。初步的功能和機(jī)制研究顯示這些等具有促進(jìn)正常細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化的能力，靶向該基因可顯著降低腫瘤細(xì)胞在體內(nèi)的增殖，提示該基因可作為胃癌治療的潛在靶點(diǎn)。另外，我們還發(fā)現(xiàn)一些癌基因可通過(guò)抑制免疫細(xì)胞的激活促進(jìn)腫瘤的免疫逃逸，靶向這些基因可提高腫瘤的免疫治療療效。
三、 實(shí)驗(yàn)室近三年發(fā)表的代表性論文
1. Qiao J#, Tian Y#, Cheng X, Liu Z, Zhou J, Gu L, Zhang B, Zhang L, Ji J, Xing R*, Deng D*: CDKN2A Deletion Leading to Hematogenous Metastasis of Human Gastric Carcinoma. Frontiers in Oncology, 2021,11:801219
2. Yang B#, Wu A#, Hu Y, Cui Tao, Wang JM, Lu Y and Xing R: Mucin 17 inhibits the progression of human gastric cancer by limiting inflammatory responses through a MYH9-p53-RhoA regulatory feedback loop. Journal of Experimental & Clinical Cancer Research, 2019, 38(1):283.
3. Xing R#,*, Zhou Y#, Yu J#, Yu YY#, Nie YZ#, Luo W#, Yang C#, Xiong T,WILLIAM k.k. Wu, Li ZH, Yang B, Lin SY, Hu YQ,Li L, Han LJ, Yang C, Huang SG,Huang SP, Zhou R, Li J, Wu KC, Fan DM, Tang GB, Dou JH, Zhu ZG, Ji JF*, Fang XD* and Lu YY*: Whole-genome sequencing reveals novel randem-duplication hotspots and a prognosis mutational signature in gastric cancer. Nature communications, 2019,10(1):2037.
4. Yan J, Yang B, Lin S, Xing R* and Lu Y*: Downregulation of miR-142-5p promotes tumor metastasis through directly regulating CYR61 expression in gastric cancer. Gastric cancer, 2019, 22(2): 302-313.
5. Xia N, Cui J, Zhu M, Xing R* and Lu Y*: Androgen receptor variant 12 promotes migration and invasion by regulating MYLK in gastric cancer. Journal of pathology, 2019, 248(3):304-315.
6. Lin S, Zhang Y, Hu Y, Yang B, Cui J, Huang J, Wang JM, Xing R* and Lu Y*: Epigenetic downregulation of MUC17 by H. pylori infection facilitates NF-κB-mediated expression of CEACAM1-3S in human gastric cancer. Gastric cancer, 2019, 22:941-954.
7. Peng L#, Xing R#, Liu D#, Bao L#, Cheng W, Wang H, Yu Y, Liu X, Jiang L, Wu Y, An Z, Liang Q, Kim RN, Shin YKe, Yang H, Wang J, Yu J, Zhang X, Xu X, Yang J, Wu K, Zhu S* and Lu*: Characterization and validation of somatic mutation spectrum to reveal heterogeneity in gastric cancer by single cell sequencing. Science Bulletin, 2019, 64:236-244.
8. Zhu M#, Wang H#, Cui J, Li W, Pan Y, An G, Zhang Q＊, Xing R＊and Lu Y＊: Calcium-binding protein S100A14 induces differentiation and suppresses metastasis in gastric cancer. Cell death and disease, 2017, 20;8(7):e2938.
9. Zhu H#, Zhang L#, Yan S, Li W, Cui J, Xia N, Yang Y, Yuan J, Chen X, Luo J, Chen R＊, Xing R＊, Lu Y＊, Wu N＊: LncRNA16 is a potential biomarker for diagnosis of early-stage lung cancer that promotes cell proliferation by regulating the cell cycle. Oncotarget, 2017, 8(5):7867-77.
10. Xing R#, Li L#, Chen L#, Gao Z#, Wang HY, Li WM, Cui JT, Tian G, Liang QY, Yu J, Sung JJ, Luo GB, Gao HJ, Xu X, Yang HM, Wang J, Zhang X, Wang JM, Huang JQ, Yu YY, Wang J＊ and Lu YY＊: Copy number variations of HLA-I and activation of NKp30 pathway determine the sensitivity of gastric cancer cells to the cytotoxicity of natural killer cells. Oncogene, 2016, 35: 2584-91.
11. Pan Y#, Lin S#, Xing R#, Zhu M, Lin B, Cui J, Li W, Gao J, Shen L, Zhao Y, Guo M, Wang JM, Huang J＊and Lu Y＊. Epigenetic Upregulation of Metallothionein 2A by Diallyl Trisulfide Enhances Chemosensitivity of Human Gastric Cancer Cells to Docetaxel through Attenuating NF-kappaB Activation. Antioxid Redox Sign, 2016, 24(15):839-54.
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